RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555470.1

PPP4R3A-209, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 3A, human

TSL 3

Gene PPP4R3A, Length 595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4R3A-209	ENST00000555470	HTR7	P34969	479 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	HNF1B	P35680	557 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	HNMT	P50135	292 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	GATM	P50440	423 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	PNLIPRP2	P54317	469 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	ASIC1	P78348	528 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	PPAT	Q06203	517 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	GRAP	Q13588	217 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	CCNI	Q14094	377 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	ACOX1	Q15067	660 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	KRT79	Q5XKE5	535 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	GBP6	Q6ZN66	633 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	RUFY3	Q7L099	469 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	XYLT1	Q86Y38	959 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	PLD5	Q8N7P1	536 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	PDPR	Q8NCN5	879 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	GAD1	Q99259	594 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	PAFAH2	Q99487	392 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	NPAS1	Q99742	590 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	SMO	Q99835	787 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	SH3GL2	Q99962	352 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	THAP1	Q9NVV9	213 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	NFS1	Q9Y697	457 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	ZMYM3	Q14202	1370 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	PIPSL	A2A3N6	862 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	CDHR4	A6H8M9	788 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	FAM86B1	E9PN63	330 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	GRM8	O00222	908 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	NKX2-8	O15522	239 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	LIAS	O43766	372 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	SLC25A17	O43808	307 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	HS6ST1	O60243	411 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	WDR47	O94967	919 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	ALPP	P05187	535 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	GPR89B	P0CG08	455 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	ALPPL2	P10696	532 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	CD19	P15391	556 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	DRD1	P21728	446 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	KEL	P23276	732 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	EPHA3	P29320	983 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	UQCRC1	P31930	480 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	PRKCI	P41743	596 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	RABIF	P47224	123 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	CAMP	P49913	170 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	KHK	P50053	298 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	MVD	P53602	400 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	CASP9	P55211	416 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	FAM189B	P81408	668 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	TLE3	Q04726	772 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	PIGF	Q07326	219 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	SGCG	Q13326	291 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	CBFB	Q13951	182 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	ZNF273	Q14593	569 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	PDK1	Q15118	436 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	PROSER3	Q2NL68	480 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP4R3A-209	ENST00000555470	HFE	Q30201	348 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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