RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 SLA2Q9H6Q3 261 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 SCUBE2Q9NQ36 999 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 CASS4Q9NQ75 786 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 NMRK1Q9NWW6 199 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 ANAPC7Q9UJX3 599 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 AGTP01019 485 aa6.34□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 AKAP12Q02952 1782 aa6.34□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 CCZ1BP86790 482 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 MKLN1Q9UL63 735 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 DYRK1BQ9Y463 629 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 SLC12A8A0AV02 714 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 AIM2O14862 343 aa6.34□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 FAM153BP0C7A2 387 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 ERFP50548 548 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 CNTN2Q02246 1040 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 PRKAA1Q13131 559 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 TMEM161AQ9NX61 479 aa6.34□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 PCDHGB4Q9UN71 923 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 SAGE2PA6NJ88 616 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 DFFAO00273 331 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 QSOX1O00391 747 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 KERAO60938 352 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 UBOX5O94941 541 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 OAZ2O95190 189 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 SLC34A2O95436 690 aa6.34□□□□□ -1.39
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