RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 KLK6Q92876 244 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-221ENST00000550734 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CS-221ENST00000550734 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CS-221ENST00000550734 CALN1Q9BXU9 219 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-221ENST00000550734 SLC17A9Q9BYT1 436 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-221ENST00000550734 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CS-221ENST00000550734 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-221ENST00000550734 FZD3Q9NPG1 666 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-221ENST00000550734 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-221ENST00000550734 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-221ENST00000550734 LHX3Q9UBR4 397 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-221ENST00000550734 PCSK1NQ9UHG2 260 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-221ENST00000550734 NENFQ9UMX5 172 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-221ENST00000550734 SATB2Q9UPW6 733 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-221ENST00000550734 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.546e-6■□□□□ 9.1
CS-221ENST00000550734 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-221ENST00000550734 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CS-221ENST00000550734 RP1P56715 2156 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-221ENST00000550734 TSPAN11A1L157 253 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 SPINT1O43278 529 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 IGSF6O95976 241 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 CSF2P04141 144 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 UGT2B4P06133 528 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 NME1P15531 152 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 ERCC2P18074 760 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 CLDN2P57739 230 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 FGL2Q14314 439 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 FZD2Q14332 565 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 CYTH1Q15438 398 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 SEL1L3Q68CR1 1132 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 Q6ZSR6 202 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 CLEC14AQ86T13 490 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 DENND6BQ8NEG7 585 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 TPCN2Q8NHX9 752 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 FAM71BQ8TC56 605 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 SPOCK2Q92563 424 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 BMFQ96LC9 184 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 KLHL32Q96NJ5 620 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 MYOCQ99972 504 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 SLC39A8Q9C0K1 460 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 MYO1AQ9UBC5 1043 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 IP6K2Q9UHH9 426 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 SALL4Q9UJQ4 1053 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 A6NNZ2 444 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 J3KR12 359 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 SLC28A2O43868 658 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 TCEA3O75764 348 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 NEBLO76041 1014 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 IL1R2P27930 398 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 CASP14P31944 242 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 GKP32189 559 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 ABL2P42684 1182 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 RHOAP61586 193 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 IL10RBQ08334 325 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 TRIM14Q14142 442 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 ZNF542PQ5EBM4 170 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 C3orf38Q5JPI3 329 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 TMCO4Q5TGY1 634 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 LEKR1Q6ZMV7 388 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 POLNQ7Z5Q5 900 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 ZNF354CQ86Y25 554 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 OR6K2Q8NGY2 324 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 CPLX3Q8WVH0 158 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 ZNF599Q96NL3 588 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 DNAJC7Q99615 494 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 THAP2Q9H0W7 228 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 ZWILCHQ9H900 591 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 DNAJC28Q9NX36 388 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 POM121BA6NF01 834 aa11.62□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 IGLON5A6NGN9 336 aa11.62□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 H3BRJ5 948 aa11.62□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa11.62□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 TOR1BO14657 336 aa11.62□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 TPP1O14773 563 aa11.62□□□□□ -0.55
CS-221ENST00000550734 DAPK3O43293 454 aa11.62□□□□□ -0.55
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