RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 IRGCQ6NXR0 463 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 EXOC3L1Q86VI1 746 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF276Q8N554 614 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 BBS2Q9BXC9 721 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 PCDH18Q9HCL0 1135 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 SPAG4Q9NPE6 437 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 CLN6Q9NWW5 311 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 HMGXB4Q9UGU5 601 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 ADGRE2Q9UHX3 823 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 CACNA1FO60840 1977 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 ZBTB22O15209 634 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 TSPAN1O60635 241 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 PIGNO95427 931 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 CLPTM1O96005 669 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 IL10RBQ08334 325 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 RAB30Q15771 203 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 XYLT1Q86Y38 959 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 OR6Y1Q8NGX8 325 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 SEMA3CQ99985 751 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 DNAJC28Q9NX36 388 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 USP20Q9Y2K6 914 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 LRRC72A6NJI9 287 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 ATP6V1G2O95670 118 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 NDUFV1P49821 464 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 DPYSQ14117 519 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 ATAT1Q5SQI0 421 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 TMC8Q8IU68 726 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 KIAA2013Q8IYS2 634 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 MAB21L3Q8N8X9 362 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 OR52K1Q8NGK4 314 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 OVCA2Q8WZ82 227 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 SMPD4Q9NXE4 827 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 SQORQ9Y6N5 450 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1B0GVM2 712 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 TCAF2A6NFQ2 919 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 BTBD19C9JJ37 291 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 ACSL4O60488 711 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 ELFN1P0C7U0 828 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 TPH1P17752 444 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 MMP8P22894 467 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 PBX3P40426 434 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 HCAR3P49019 387 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 MBTD1Q05BQ5 628 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 SPIRE1Q08AE8 756 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 MTRRQ9UBK8 725 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 HDAC3O15379 428 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 POP4O95707 220 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 C8GP07360 202 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 CRHR1P34998 444 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 IL5RAQ01344 420 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 TRIM16LQ309B1 348 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 TTC27Q6P3X3 843 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC81Q6ZN84 652 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 NEK10Q6ZWH5 1172 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 EPHX4Q8IUS5 362 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 CAMKK1Q8N5S9 505 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 RORBQ92753 470 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 AZIN2Q96A70 460 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM79Q9BSE2 394 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 UBP1Q9NZI7 540 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 LIMD1Q9UGP4 676 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 FSBPO95073 299 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 NDUFS1P28331 727 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 ADRA1BP35368 520 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 DLG4P78352 724 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 TEX44Q53QW1 395 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 LDLRAP1Q5SW96 308 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 DNAAF5Q86Y56 855 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 KIF2BQ8N4N8 673 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF614Q8N883 585 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 POMGNT2Q8NAT1 580 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 PHF21BQ96EK2 531 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 SLC25A51Q9H1U9 297 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 ZSCAN32Q9NX65 697 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 TAF4O00268 1085 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 AZIN1O14977 448 aa8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms