RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 ARHGAP42A6NI28 874 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 METTL12A8MUP2 240 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 FLRT2O43155 660 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 RRP8O43159 456 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 FSBPO95073 299 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 NDUFA10O95299 355 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 LCA5LO95447 670 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 SEMA4FO95754 770 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 CER1O95813 267 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 IL4RP24394 825 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 CDC25BP30305 580 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 ARHGAP25P42331 645 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 SEMG2Q02383 582 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 DPYSQ14117 519 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 CYTH1Q15438 398 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 PARP15Q460N3 678 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 WDR45BQ5MNZ6 344 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 DCAF12L1Q5VU92 463 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 FAM46CQ5VWP2 391 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 PCSK4Q6UW60 755 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 DHRS13Q6UX07 377 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 USP30Q70CQ3 517 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 GPR155Q7Z3F1 870 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 DSG4Q86SJ6 1040 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 NPWQ8N729 165 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 OR6K2Q8NGY2 324 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 OR14C36Q8NHC7 312 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 SNX19Q92543 992 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 CCDC114Q96M63 670 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 HEPHQ9BQS7 1158 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 CALN1Q9BXU9 219 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 DONSONQ9NYP3 566 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 IMPACTQ9P2X3 320 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 IL36AQ9UHA7 158 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 BTBD3Q9Y2F9 522 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 TMEM131Q92545 1883 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 TBC1D3EA0A087X179 549 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 CAPN8A6NHC0 703 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 TBC1D3LB9A6J9 549 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 KRIT1O00522 736 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 ALOX15BO15296 676 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 LEFTY1O75610 366 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 MTA2O94776 668 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 TMCC1O94876 653 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 FURINP09958 794 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 TBC1D3HP0C7X1 549 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 ZNF883P0CG24 379 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 MAPK1P28482 360 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 MAN1A1P33908 653 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 DRD3P35462 400 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 ARSEP51690 589 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 CNTN1Q12860 1018 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 DPYSL3Q14195 570 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 AFMIDQ63HM1 303 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 NCEH1Q6PIU2 408 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 TMCO3Q6UWJ1 677 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 LZTR1Q8N653 840 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 ACRBPQ8NEB7 543 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 TMIEQ8NEW7 156 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 CADM4Q8NFZ8 388 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 RAPGEF5Q92565 580 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 ARRDC3Q96B67 414 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 BIRC7Q96CA5 298 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 CEP44Q9C0F1 390 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 GOLPH3Q9H4A6 298 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 SGK2Q9HBY8 427 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 LCMT1Q9UIC8 334 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 DUSP10Q9Y6W6 482 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-217ENST00000550044 COL12A1Q99715 3063 aa9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms