RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 TMC3Q7Z5M5 1100 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 ANKMY2Q8IV38 441 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 KCNV2Q8TDN2 545 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 OR8D1Q8WZ84 308 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 IFT43Q96FT9 208 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 SIGLEC10Q96LC7 697 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 ZNF778Q96MU6 729 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 FAM129AQ9BZQ8 928 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 EPB41L4BQ9H329 900 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 SAYSD1Q9NPB0 183 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 CD93Q9NPY3 652 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 HAUS2Q9NVX0 235 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 SERGEFQ9UGK8 458 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 MMP17Q9ULZ9 603 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 SLC8A2Q9UPR5 921 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 CHMP2BQ9UQN3 213 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 TECTAO75443 2155 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 A0A0J9YYE9 177 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 GOLGA6CA6NDK9 693 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 GOLGA6BA6NDN3 693 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 SMAPO00193 183 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 NPC1O15118 1278 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 ALOX15BO15296 676 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 MID1O15344 667 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 IL1BP01584 269 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 TRBC1P01850 177 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 FGF1P05230 155 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 GOLGA6DP0CG33 693 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 MLNP12872 115 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 TIMP2P16035 220 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 HLA-DPA1P20036 260 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 LHCGRP22888 699 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 DRD3P35462 400 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 ELK3P41970 407 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 ABL2P42684 1182 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 ARL4CP56559 192 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 RPS14P62263 151 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 SATB1Q01826 763 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 CDH17Q12864 832 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 CBLBQ13191 982 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 PTPRCAPQ14761 206 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 CST6Q15828 149 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 CDKN3Q16667 212 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 ZNF805Q5CZA5 627 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 CES3Q6UWW8 571 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 LINC00523Q86TU6 105 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 TSPAN33Q86UF1 283 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 ZBED8Q8IZ13 594 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 TTC30BQ8N4P2 665 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 AADATQ8N5Z0 425 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 DNAAF3Q8N9W5 541 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 TMIEQ8NEW7 156 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 FLCNQ8NFG4 579 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 MDGA1Q8NFP4 955 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 PJA1Q8NG27 643 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 OR2T3Q8NH03 318 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 SPOCK2Q92563 424 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 EID2BQ96D98 161 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 RMDN1Q96DB5 314 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 C9orf72Q96LT7 481 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 SEMA4AQ9H3S1 761 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 NINJ2Q9NZG7 142 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 SUN2Q9UH99 717 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 GGT7Q9UJ14 662 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 ITM2BQ9Y287 266 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 KCTD3Q9Y597 815 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 TEX264Q9Y6I9 313 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 CCDC151A5D8V7 595 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 CAPN8A6NHC0 703 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 C16orf96A6NNT2 1141 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 A8MX80 341 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 UPK3BL1B0FP48 263 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 ANKRD66B4E2M5 251 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 UPK3BL2E5RIL1 263 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 CCL22O00626 93 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 NDC80O14777 642 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 LDB2O43679 373 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 PI15O43692 258 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 BUD23O43709 281 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 SLC4A1P02730 911 aa8.18□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms