RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	KBTBD6	Q86V97	674 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	CCDC25	Q86WR0	208 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	PDIK1L	Q8N165	341 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	ART4	Q93070	314 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	HHIP	Q96QV1	700 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	FMO2	Q99518	471 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	GDF3	Q9NR23	364 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	HACD3	Q9P035	362 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658		A0A1W2PP55	124 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	NEMP1	O14524	444 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	PPFIA2	O75334	1257 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	APBB3	O95704	486 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	PDHA1	P08559	390 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	NDUFV2	P19404	249 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	ADRA1A	P35348	466 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	CHRNA4	P43681	627 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	CXCL12	P48061	93 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	SUOX	P51687	545 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	CLCN5	P51795	746 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	FAM193A	P78312	1265 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	FZD5	Q13467	585 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	OLIG2	Q13516	323 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	ARHGEF7	Q14155	803 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	ELF2	Q15723	593 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	ANO7	Q6IWH7	933 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	CASC4	Q6P4E1	433 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	TTC7B	Q86TV6	843 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	SEC14L1	Q92503	715 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	RAB7B	Q96AH8	199 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	ARRDC3	Q96B67	414 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	SERPINB12	Q96P63	405 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	CASS4	Q9NQ75	786 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	SARDH	Q9UL12	918 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		11.96	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658		A0A0J9YYE9	177 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	TSPAN11	A1L157	253 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	CAPN8	A6NHC0	703 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	FZD6	O60353	706 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	CRTAM	O95727	393 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	TRBC1	P01850	177 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	SLC4A1	P02730	911 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	ADRB3	P13945	408 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	CTPS1	P17812	591 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	GABRG2	P18507	467 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	TNFRSF8	P28908	595 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	NPY2R	P49146	381 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	MTAP	Q13126	283 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	GAS6	Q14393	721 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	QPCT	Q16769	361 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	UGP2	Q16851	508 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	BBS9	Q3SYG4	887 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	MAP9	Q49MG5	647 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	DENND2C	Q68D51	928 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	RANBP10	Q6VN20	620 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	TRIB3	Q96RU7	358 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	HDAC8	Q9BY41	377 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	IL22	Q9GZX6	179 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	EPC1	Q9H2F5	836 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	NFU1	Q9UMS0	254 aa		11.95	□□□□□ -0.5

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