RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522111.2

TRNP1-201, Transcript of TMF1-regulated nuclear protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRNP1, Length 1,958 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1-201ENST00000522111 MROH9Q5TGP6 573 aa27.4■■□□□ 1.98
TRNP1-201ENST00000522111 PDPK2PQ6A1A2 396 aa27.4■■□□□ 1.98
TRNP1-201ENST00000522111 PACS1Q6VY07 963 aa27.4■■□□□ 1.98
TRNP1-201ENST00000522111 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa27.4■■□□□ 1.98
TRNP1-201ENST00000522111 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa27.4■■□□□ 1.98
TRNP1-201ENST00000522111 ANKRD66B4E2M5 251 aa27.39■■□□□ 1.98
TRNP1-201ENST00000522111 SPAG7O75391 227 aa27.39■■□□□ 1.98
TRNP1-201ENST00000522111 CA4P22748 312 aa27.39■■□□□ 1.98
TRNP1-201ENST00000522111 EPHB1P54762 984 aa27.39■■□□□ 1.98
TRNP1-201ENST00000522111 TMPRSS15P98073 1019 aa27.39■■□□□ 1.98
TRNP1-201ENST00000522111 GUCY1A3Q02108 690 aa27.39■■□□□ 1.98
TRNP1-201ENST00000522111 RALGPS1Q5JS13 557 aa27.39■■□□□ 1.98
TRNP1-201ENST00000522111 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa27.39■■□□□ 1.98
TRNP1-201ENST00000522111 OR13J1Q8NGT2 312 aa27.39■■□□□ 1.98
TRNP1-201ENST00000522111 NXPE3Q969Y0 559 aa27.39■■□□□ 1.98
TRNP1-201ENST00000522111 E2F7Q96AV8 911 aa27.39■■□□□ 1.98
TRNP1-201ENST00000522111 MYO19Q96H55 970 aa27.39■■□□□ 1.98
TRNP1-201ENST00000522111 DEC1Q9P2X7 70 aa27.39■■□□□ 1.98
TRNP1-201ENST00000522111 A0A0U1RQS6 177 aa27.39■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 TMEM120BA0PK00 339 aa27.39■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 MROH6A6NGR9 719 aa27.39■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 KRT37O76014 449 aa27.39■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 KRT4P19013 534 aa27.39■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 PAMP19021 973 aa27.39■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 GDI1P31150 447 aa27.39■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 ABCG1P45844 678 aa27.39■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 BRSK1Q8TDC3 778 aa27.39■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 ELSPBP1Q96BH3 223 aa27.39■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 MRGPRX3Q96LB0 322 aa27.39■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa27.39■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa27.39■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 TTC34A8MYJ7 566 aa27.38■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 ABL2P42684 1182 aa27.38■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 RUNX3Q13761 415 aa27.38■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 ARMC12Q5T9G4 340 aa27.38■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa27.38■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa27.38■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 STRA8Q7Z7C7 330 aa27.38■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 CPA6Q8N4T0 437 aa27.38■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 ZNF366Q8N895 744 aa27.38■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 SMC6Q96SB8 1091 aa27.38■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 TMEM265A0A087WTH1 108 aa27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 HMX2A2RU54 273 aa27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 PRRT4C9JH25 899 aa27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 KRT38O76015 456 aa27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 MT-ND3P03897 115 aa27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 CTPS1P17812 591 aa27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 MAPK8P45983 427 aa27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 CSNK1DP48730 415 aa27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 NAB1Q13506 487 aa27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 QPCTQ16769 361 aa27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 GRAMD4Q6IC98 578 aa27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 ZNF449Q6P9G9 518 aa27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 SFTPA1Q8IWL2 248 aa27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 ANKRD42Q8N9B4 389 aa27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 MDGA1Q8NFP4 955 aa27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 MGARPQ8TDB4 240 aa27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 LRCH3Q96II8 777 aa27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 SERAC1Q96JX3 654 aa27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 CEP44Q9C0F1 390 aa27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 MTG2Q9H4K7 406 aa27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 GGT7Q9UJ14 662 aa27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 FZD6O60353 706 aa27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 PGLSO95336 258 aa27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 ARSDP51689 593 aa27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 PTPRNQ16849 979 aa27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 MYLK3Q32MK0 819 aa27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 DENND6AQ8IWF6 608 aa27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 CHST14Q8NCH0 376 aa27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 OR13C4Q8NGS5 318 aa27.37■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 A0A1W2PPC1 479 aa27.36■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 CHN1P15882 459 aa27.36■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 SERPINA4P29622 427 aa27.36■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 CARD16Q5EG05 197 aa27.36■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 LGSNQ5TDP6 509 aa27.36■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 EMC10Q5UCC4 262 aa27.36■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 CPNE1Q99829 537 aa27.36■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 MLXIPLQ9NP71 852 aa27.36■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 ACTL7BQ9Y614 415 aa27.36■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 NUMBLQ9Y6R0 609 aa27.36■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 DLDP09622 509 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 ALPIP09923 528 aa27.35■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 GP5P40197 560 aa27.35■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 NNMTP40261 264 aa27.35■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 CTBP1Q13363 440 aa27.35■■□□□ 1.97
TRNP1-201ENST00000522111 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms