RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513974.5

RAI14-222, Transcript of retinoic acid induced 14, human

TSL 4

Gene RAI14, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAI14-222	ENST00000513974	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
RAI14-222	ENST00000513974	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		13.35	□□□□□ -0.27
RAI14-222	ENST00000513974	SHC3	Q92529	594 aa		13.35	□□□□□ -0.27
RAI14-222	ENST00000513974	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		13.35	□□□□□ -0.27
RAI14-222	ENST00000513974	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		13.35	□□□□□ -0.27
RAI14-222	ENST00000513974	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		13.35	□□□□□ -0.27
RAI14-222	ENST00000513974	BICDL2	A1A5D9	508 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RAI14-222	ENST00000513974	BLACE	A4D250	179 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RAI14-222	ENST00000513974	TNFRSF10C	O14798	259 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RAI14-222	ENST00000513974	B4GAT1	O43505	415 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RAI14-222	ENST00000513974	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
RAI14-222	ENST00000513974	LIF	P15018	202 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RAI14-222	ENST00000513974	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
RAI14-222	ENST00000513974	ITIH2	P19823	946 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RAI14-222	ENST00000513974	UGT1A3	P35503	534 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RAI14-222	ENST00000513974	GABRB2	P47870	512 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RAI14-222	ENST00000513974	CD97	P48960	835 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RAI14-222	ENST00000513974	ARSD	P51689	593 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RAI14-222	ENST00000513974	MTM1	Q13496	603 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RAI14-222	ENST00000513974	TCEA2	Q15560	299 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RAI14-222	ENST00000513974	MAP9	Q49MG5	647 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RAI14-222	ENST00000513974	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RAI14-222	ENST00000513974	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
RAI14-222	ENST00000513974	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RAI14-222	ENST00000513974	NLRP14	Q86W24	1093 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RAI14-222	ENST00000513974	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RAI14-222	ENST00000513974	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
RAI14-222	ENST00000513974	DDA1	Q9BW61	102 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RAI14-222	ENST00000513974	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
RAI14-222	ENST00000513974	OR1A2	Q9Y585	309 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RAI14-222	ENST00000513974	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RAI14-222	ENST00000513974	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
RAI14-222	ENST00000513974	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	CFAP69	A5D8W1	941 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	AGRP	O00253	132 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	KDELR3	O43731	214 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	IGSF6	O95976	241 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	RHOQ	P17081	205 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	KEL	P23276	732 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	KIAA1024L	P59773	190 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	NR1D2	Q14995	579 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	GJB7	Q6PEY0	223 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	ARC	Q7LC44	396 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	MIB2	Q96AX9	1013 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	C18orf8	Q96DM3	657 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	HMCES	Q96FZ2	354 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	PDXP	Q96GD0	296 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	RDH14	Q9HBH5	336 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	CREBBP	Q92793	2442 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	TSPAN11	A1L157	253 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	RAMP2	O60895	175 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	TMCC1	O94876	653 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	GPR3	P46089	330 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	SQSTM1	Q13501	440 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	GRM3	Q14832	879 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	UGP2	Q16851	508 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	KCTD16	Q68DU8	428 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	ATCAY	Q86WG3	371 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	FAM131B	Q86XD5	332 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	NELFB	Q8WX92	580 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	TIGD1	Q96MW7	591 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	DNAI1	Q9UI46	699 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	TMEM202	A6NGA9	273 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	ENO4	A6NNW6	628 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974		B4DGG1	531 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974		B4E171	279 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RAI14-222	ENST00000513974	BUB1	O43683	1085 aa		13.31	□□□□□ -0.28

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.4 ms