RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-216ENST00000495123 PGLSO95336 258 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 PDHA1P08559 390 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 SERPINF2P08697 491 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 RBP3P10745 1247 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 GNSP15586 552 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 ENGP17813 658 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 XPAP23025 273 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 CD68P34810 354 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 CD86P42081 329 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 ATP5OP48047 213 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 PRSS12P56730 875 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 SKOR1P84550 965 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 BNC1Q01954 994 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 RALGDSQ12967 914 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 XRCC4Q13426 336 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 PTPRRQ15256 657 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 TMEM52BQ4KMG9 183 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 SLC45A4Q5BKX6 768 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 RALGPS1Q5JS13 557 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 SEL1L2Q5TEA6 688 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 PAF1Q8N7H5 531 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 OR2I1PQ8NGU4 316 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 CEP76Q8TAP6 659 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 HTR3CQ8WXA8 447 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 FEM1CQ96JP0 617 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 SERAC1Q96JX3 654 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 TEKT5Q96M29 485 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 SMIM14Q96QK8 99 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 EDEM2Q9BV94 578 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 TLR10Q9BXR5 811 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 SLC6A14Q9UN76 642 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 COQ6Q9Y2Z9 468 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa8.71□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 MYO15AQ9UKN7 3530 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 PCDH15Q96QU1 1955 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 A0A0U1RQS6 177 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 A0A1W2PR77 199 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 A8MX80 341 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 F5H423 210 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 H0Y8X5 98 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 KCNK3O14649 394 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 ENC1O14682 589 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 ZSCAN12O43309 604 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 CPP00450 1065 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 PRLP01236 227 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 ALPIP09923 528 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 CTPS1P17812 591 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 NFKB1P19838 968 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 CES1P23141 567 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 MMP12P39900 470 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 GRIA4P48058 902 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 CLDN2P57739 230 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 RPS21P63220 83 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 RACK1P63244 317 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 FAM193AP78312 1265 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 ELP6Q0PNE2 266 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 GRIK2Q13002 908 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 KIF19Q2TAC6 998 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 ZNF569Q5MCW4 686 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 ARMC12Q5T9G4 340 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 KDM7AQ6ZMT4 941 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 GCNT7Q6ZNI0 430 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 RABEPKQ7Z6M1 372 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 ZNF567Q8N184 647 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 SLC35F6Q8N357 371 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 TMEM145Q8NBT3 493 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 SPATA22Q8NHS9 363 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 CXorf40AQ8TE69 158 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 PIH1D2Q8WWB5 315 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 TADA1Q96BN2 335 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 KCNK17Q96T54 332 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 SLC17A9Q9BYT1 436 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 SLC25A51Q9H1U9 297 aa8.7□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 CARD9Q9H257 536 aa8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms