RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490575.1

PTPRVP-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRVP, Length 953 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-202ENST00000490575 GSDMDP57764 484 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 BNIP3Q12983 259 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 TEAD4Q15561 434 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 PPM1JQ5JR12 505 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 DBX2Q6ZNG2 339 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 GATAD2AQ86YP4 633 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 RCOR2Q8IZ40 523 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 PELI3Q8N2H9 469 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 MFSD2AQ8NA29 543 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 EXD1Q8NHP7 514 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 KIAA1524Q8TCG1 905 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 CENPTQ96BT3 561 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 GPR27Q9NS67 375 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 TM7SF3Q9NS93 570 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 SPTBN2O15020 2390 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 CACNA1AO00555 2505 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 NEMP1O14524 444 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 FZD6O60353 706 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 LIG3P49916 1009 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 ITKQ08881 620 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 CCDC15Q0P6D6 951 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 AP1B1Q10567 949 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 STAT4Q14765 748 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 TFDP3Q5H9I0 405 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 BRAT1Q6PJG6 821 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 PIH1D2Q8WWB5 315 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 FAM118BQ9BPY3 351 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 RAI2Q9Y5P3 530 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 A0A1B0GTQ1 180 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 CBFA2T3O75081 653 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 PGLSO95336 258 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 ALPIP09923 528 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 THEGLP0DJG4 465 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 C6P13671 934 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 CTPS1P17812 591 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 SDHBP21912 280 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 KCNA4P22459 653 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 LHCGRP22888 699 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 CD68P34810 354 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 C21orf59P57076 290 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 SKOR1P84550 965 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 WASHC5Q12768 1159 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 KIF5AQ12840 1032 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 GRM3Q14832 879 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 KCTD16Q68DU8 428 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 LIPIQ6XZB0 460 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 Q6ZSR6 202 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 RFLNAQ6ZTI6 216 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 TSPAN33Q86UF1 283 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 CCDC50Q8IVM0 306 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 BRD8Q9H0E9 1235 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 B4GALT6Q9UBX8 382 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 KLF15Q9UIH9 416 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 TTLL3Q9Y4R7 772 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 ARHGAP6O43182 974 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 TM7SF2O76062 418 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 CER1O95813 267 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 MX2P20592 715 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 AKT2P31751 481 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 NUDT1P36639 197 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 IRF4Q15306 451 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 CNGA3Q16281 694 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 PPP2R5EQ16537 467 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 WSCD2Q2TBF2 565 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 ZNF542PQ5EBM4 170 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 IL27RAQ6UWB1 636 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 BBS12Q6ZW61 710 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 DPPA4Q7L190 304 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 PLA2G15Q8NCC3 412 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 CXorf40AQ8TE69 158 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 NSMCE1Q8WV22 266 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 SPOCK2Q92563 424 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 KLHDC7BQ96G42 594 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-202ENST00000490575 SEPT10Q9P0V9 454 aa16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms