RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489352.5

HDAC6-233, Transcript of histone deacetylase 6, human

TSL 4

Gene HDAC6, Length 585 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC6-233	ENST00000489352	FBXO21	O94952	628 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	SLC2A3	P11169	496 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	SSTR2	P30874	369 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	ABL2	P42684	1182 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	ART3	Q13508	389 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	NR1D2	Q14995	579 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	CARD16	Q5EG05	197 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	FBXL22	Q6P050	247 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	NXPE1	Q8N323	547 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	TMC2	Q8TDI7	906 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	BACH2	Q9BYV9	841 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	ADCY5	O95622	1261 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	ECEL1	O95672	775 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	KEL	P23276	732 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	GPLD1	P80108	840 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	AMPD3	Q01432	767 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	FOXM1	Q08050	763 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	SQSTM1	Q13501	440 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	PEX6	Q13608	980 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	CPZ	Q66K79	652 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	TAC4	Q86UU9	113 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	OR10G6	Q8NH81	332 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	CEP44	Q9C0F1	390 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	RTTN	Q86VV8	2226 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352		A0A1B0GUH1	482 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	TIMP2	P16035	220 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	CSF2RB	P32927	897 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	GCLM	P48507	274 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	CDH4	P55283	916 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	DPYD	Q12882	1025 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	DNASE1L3	Q13609	305 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	FJX1	Q86VR8	437 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	RNF31	Q96EP0	1072 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	PADI1	Q9ULC6	663 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		11.6	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		11.59	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352		A6NL46	340 aa		11.59	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	KRIT1	O00522	736 aa		11.59	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	PCCB	P05166	539 aa		11.59	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	FGF1	P05230	155 aa		11.59	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	CCR1	P32246	355 aa		11.59	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	GLRB	P48167	497 aa		11.59	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	VAMP7	P51809	220 aa		11.59	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	SLC20A2	Q08357	652 aa		11.59	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	11.59	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		11.59	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		11.59	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		11.59	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		11.59	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	PMF1	Q6P1K2	205 aa		11.59	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		11.59	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	PDILT	Q8N807	584 aa		11.59	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		11.59	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		11.59	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		11.59	□□□□□ -0.55
HDAC6-233	ENST00000489352	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		11.59	□□□□□ -0.55

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