RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487186.5

FAAP20-213, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 2

Gene FAAP20, Length 3,576 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-213	ENST00000487186	ASB14	A6NK59	587 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	GSTM1	P09488	218 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	INHBB	P09529	407 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	CTBS	Q01459	385 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	HIF1A	Q16665	826 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	C16orf89	Q6UX73	402 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	BANP	Q8N9N5	519 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	TOMM70	O94826	608 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	DPYS	Q14117	519 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	MTX3	Q5HYI7	312 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	ZFP42	Q96MM3	310 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	CPXM1	Q96SM3	734 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	ING2	Q9H160	280 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	CEP290	O15078	2479 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	ACKR2	O00590	384 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	CXCL11	O14625	94 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	ENPP3	O14638	875 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	C8B	P07358	591 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	PKLR	P30613	574 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	GPR142	Q7Z601	462 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	MARK4	Q96L34	752 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	NFASC	O94856	1347 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	C7orf72	A4D263	438 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	PDPK1	O15530	556 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	CBX5	P45973	191 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	SPCS2	Q15005	226 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	LYPD8	Q6UX82	237 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	LPP	Q93052	612 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	DPP3	Q9NY33	737 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	MTRR	Q9UBK8	725 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	NAGA	P17050	411 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	SMPD1	P17405	629 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	CKMT2	P17540	419 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	GCA	P28676	217 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	GAD2	Q05329	585 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	IKBKE	Q14164	716 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	CHSY1	Q86X52	802 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	CNMD	O75829	334 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	PROSC	O94903	275 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	CALB1	P05937	261 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	COX4I1	P13073	169 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	FMO4	P31512	558 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	GPX6	P59796	221 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	OGDH	Q02218	1023 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	LGSN	Q5TDP6	509 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	LILRA2	Q8N149	483 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	CCNY	Q8ND76	341 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	AGR3	Q8TD06	166 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	IL12RB2	Q99665	862 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	RNF39	Q9H2S5	420 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	TPST1	O60507	370 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	ZNF254	O75437	659 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAAP20-213	ENST00000487186	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21

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