RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487064.1

RPS3AP50-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 50, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP50, Length 803 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP50-201ENST00000487064 MMS19Q96T76 1030 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 TSG101Q99816 390 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 RHOXF2Q9BQY4 288 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 MXD3Q9BW11 206 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 EDEM3Q9BZQ6 932 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 TSGA10Q9BZW7 698 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 GLT8D2Q9H1C3 349 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 NDST4Q9H3R1 872 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 NRIP3Q9NQ35 241 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 TRIM36Q9NQ86 728 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 PRDM8Q9NQV8 689 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 PANK4Q9NVE7 773 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 RRN3Q9NYV6 651 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 PDP2Q9P2J9 529 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 HDAC6Q9UBN7 1215 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 VPS51Q9UID3 782 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 SERTAD3Q9UJW9 196 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 USP22Q9UPT9 525 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 SAR1BQ9Y6B6 198 aa4□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 ANK1P16157 1881 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 A0A1B0GVC2 190 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 ERICH4A6NGS2 130 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 HMX3A6NHT5 357 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 TARM1B6A8C7 271 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 E9PMD0 336 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 H3BQF6 201 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 PCDH17O14917 1159 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 ZNF263O14978 683 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 DNPH1O43598 174 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 PLA2G4BP0C869 781 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 DRD4P21917 467 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 MCM3P25205 808 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 ITPKBP27987 946 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 RBL1P28749 1068 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 ALDH1B1P30837 517 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 SLC16A2P36021 539 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 VSNL1P62760 191 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 KIF5AQ12840 1032 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 COASYQ13057 564 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 GPS2Q13227 327 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 CSHL1Q14406 222 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 SPA17Q15506 151 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 QRICH1Q2TAL8 776 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 TRIM60Q495X7 471 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 CCDC40Q4G0X9 1142 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 ZCWPW2Q504Y3 356 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 TAF3Q5VWG9 929 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 RINT1Q6NUQ1 792 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 MOGAT3Q86VF5 341 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 GPBP1Q86WP2 473 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 CCDC65Q8IXS2 484 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 IZUMO1Q8IYV9 350 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 MYOCDQ8IZQ8 938 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 NAXEQ8NCW5 288 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 TEKT1Q969V4 418 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 EEF2KMTQ96G04 330 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 CAPZA3Q96KX2 299 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 MBOAT7Q96N66 472 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 VN1R3Q9BXE9 311 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 NT5C3AQ9H0P0 336 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 SH2D4AQ9H788 454 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 PSTPIP2Q9H939 334 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 MLXIPQ9HAP2 919 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 AS3MTQ9HBK9 375 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 PSD3Q9NYI0 1048 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 NYAP2Q9P242 653 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 STEAP1Q9UHE8 339 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 PCDHA12Q9UN75 941 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 RLFQ13129 1914 aa3.99□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 DOCK1Q14185 1865 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 MCM3APO60318 1980 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 PHIPQ8WWQ0 1821 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 LCTP09848 1927 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 PTPRFP10586 1907 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 MACROD2A1Z1Q3 448 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 LRRC53A6NM62 1247 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP50-201ENST00000487064 J3KTA2 159 aa3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms