RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486388.5

UBP1-210, Transcript of upstream binding protein 1, human

TSL 3

Gene UBP1, Length 928 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBP1-210	ENST00000486388	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	CHSY1	Q86X52	802 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	SCML4	Q8N228	414 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ARL14	Q8N4G2	192 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	OR4C6	Q8NH72	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	RFFL	Q8WZ73	363 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	PAGE5	Q96GU1	130 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TSG101	Q99816	390 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	CALN1	Q9BXU9	219 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	SP110	Q9HB58	689 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	USP29	Q9HBJ7	922 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	PREB	Q9HCU5	417 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	RMND1	Q9NWS8	449 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	PPT2	Q9UMR5	302 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	NUMA1	Q14980	2115 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	KNL1	Q8NG31	2342 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	PLXNA2	O75051	1894 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388		A0A1W2PR77	199 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TTC34	A8MYJ7	566 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388		M0QYV0	167 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	FFAR2	O15552	330 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	LAT	O43561	262 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	SIGLEC6	O43699	453 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	SLC28A2	O43868	658 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	KLRC4	O43908	158 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	OPA1	O60313	960 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	SDC3	O75056	442 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	RHOBTB3	O94955	611 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ATE1	O95260	518 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	IGLV3-27	P01718	113 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	MPO	P05164	745 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	GP1BA	P07359	652 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	SFTPC	P11686	197 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	CKMT1A	P12532	417 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	C6	P13671	934 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	DGKA	P23743	735 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	LSS	P48449	732 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	INHBC	P55103	352 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	SNX16	P57768	344 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	DAOA	P59103	153 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	PPP3CA	Q08209	521 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	STIM1	Q13586	685 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	KCNJ12	Q14500	433 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	NR0B2	Q15466	257 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	NEK5	Q6P3R8	708 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TMEM270	Q6UE05	265 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TMC6	Q7Z403	805 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TRIM69	Q86WT6	500 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ERICH1	Q86X53	443 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	LGI2	Q8N0V4	545 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	STK40	Q8N2I9	435 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	WDR48	Q8TAF3	677 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	UBA3	Q8TBC4	463 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	MED8	Q96G25	268 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	MED15	Q96RN5	788 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TM9SF2	Q99805	663 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	SGPP1	Q9BX95	441 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	MIS12	Q9H081	205 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	MTG2	Q9H4K7	406 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ST7	Q9NRC1	585 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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