RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 MYO1AQ9UBC5 1043 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 U3KQA8 63 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 APC2O95996 2303 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 FREM2Q5SZK8 3169 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 TSPAN11A1L157 253 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 GCATO75600 419 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 RASGRP1O95267 797 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 MYBL1P10243 752 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 TSHRP16473 764 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 ERCC2P18074 760 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 TGM2P21980 687 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 MIPP30301 263 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 LSSP48449 732 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 ZNF165P49910 485 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 RENBPP51606 427 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 TPM4P67936 248 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 NFATC4Q14934 902 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 CA9Q16790 459 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 CRTC1Q6UUV9 634 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 GKN2Q86XP6 184 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 LZTR1Q8N653 840 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 SYT11Q9BT88 431 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 APOOQ9BUR5 198 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 THSD1Q9NS62 852 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 AIPL1Q9NZN9 384 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 TMEM63CQ9P1W3 806 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 GULP1Q9UBP9 304 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 A0A1W2PQC6 194 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 H3BRJ5 948 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 YY2O15391 372 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 PCCBP05166 539 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 ARL4AP40617 200 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 HK3P52790 923 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 IL10RBQ08334 325 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 INPP5AQ14642 412 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 WSCD2Q2TBF2 565 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 C3orf38Q5JPI3 329 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 EDEM3Q9BZQ6 932 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 KLQ9UEF7 1012 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 PADI4Q9UM07 663 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 TCEA3O75764 348 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 TNFP01375 233 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 KELP23276 732 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 NFKBIAP25963 317 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 PRKCIP41743 596 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 HCAR3P49019 387 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 SCNN1BP51168 640 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 ERVPABLB-1P60509 514 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 MTM1Q13496 603 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 SPIDRQ14159 915 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 LVRNQ6Q4G3 990 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 GPR155Q7Z3F1 870 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 SLC35F3Q8IY50 421 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 BBS5Q8N3I7 341 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 WDR92Q96MX6 357 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 PEBP4Q96S96 227 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 PRORYQ9H606 182 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 SIRPGQ9P1W8 387 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 SEPT3Q9UH03 358 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 SATB2Q9UPW6 733 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 OR1A2Q9Y585 309 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 DSPP15924 2871 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 CFAP69A5D8W1 941 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 PRKCGP05129 697 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 ELFN1P0C7U0 828 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 MMP12P39900 470 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 SRP54P61011 504 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 CXADRP78310 365 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 ZNF235Q14590 738 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 FOXR1Q6PIV2 292 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 SPACA3Q8IXA5 215 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 ARL10Q8N8L6 244 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 NSMCE1Q8WV22 266 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 CCDC3Q9BQI4 270 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 CLPBQ9H078 707 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 RAI2Q9Y5P3 530 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 A0A1W2PQ67 120 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.841e-323■□□□□ 8.9
ACTB-212ENST00000484841 DXOO77932 396 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 SKILP12757 684 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 RGRP47804 291 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 UCNP55089 124 aa20.27■□□□□ 0.84
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