RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480171.7

PKP4-210, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 2,772 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-210ENST00000480171 STX1BP61266 288 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 SULT2A1Q06520 285 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 LRP8Q14114 963 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 SEPT6Q14141 434 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 CSHL1Q14406 222 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 CYTH1Q15438 398 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 NEPROQ6NW34 567 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 CNSTQ6PJW8 725 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 MOB2Q70IA6 237 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 SLC22A9Q8IVM8 553 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 SPATA6LQ8N4H0 392 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 LZTR1Q8N653 840 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 DNAJB3Q8WWF6 145 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 LPGAT1Q92604 370 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 MAML3Q96JK9 1138 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 FTHL17Q9BXU8 183 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 COQ10BQ9H8M1 238 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 MEAF6Q9HAF1 191 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 SLC38A7Q9NVC3 462 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 CROTQ9UKG9 612 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 CDH9Q9ULB4 789 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 PCDHGB4Q9UN71 923 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 MRASO14807 208 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 MATN3O15232 486 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 IPO13O94829 963 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 HTR7P34969 479 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 PFKPQ01813 784 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 IKBKEQ14164 716 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 GK3PQ14409 553 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 COL19A1Q14993 1142 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 NRF1Q16656 503 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 TECRLQ5HYJ1 363 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 KIAA0319Q5VV43 1072 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 LZICQ8WZA0 190 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 DPF3Q92784 378 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 SMARCD1Q96GM5 515 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 PCED1BQ96HM7 432 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 IL12RB2Q99665 862 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 TRMOQ9BU70 441 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 TBC1D13Q9NVG8 400 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 MYRFQ9Y2G1 1151 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 SNX13Q9Y5W8 968 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 AK5Q9Y6K8 562 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 ZNF236Q9UL36 1845 aa8.75□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 TRIM24O15164 1050 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 H6PDO95479 791 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 SPATA31D3P0C874 917 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 ZNF23P17027 643 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 PCSK1P29120 753 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 RANBP1P43487 201 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 CLCN5P51795 746 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 RABGGTBP53611 331 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 DENND5AQ6IQ26 1287 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 HACD2Q6Y1H2 254 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 AMIGO2Q86SJ2 522 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 CUZD1Q86UP6 607 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 TAC4Q86UU9 113 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 RNF135Q8IUD6 432 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 HERC6Q8IVU3 1022 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 CHPFQ8IZ52 775 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 ZMIZ2Q8NF64 920 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 TRPC4APQ8TEL6 797 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 LRTOMTQ8WZ04 291 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 CDCA5Q96FF9 252 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 TMEM79Q9BSE2 394 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 TRIM15Q9C019 465 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 SIK2Q9H0K1 926 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 PCDHAC1Q9H158 963 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 CYP4F12Q9HCS2 524 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 PNPLA3Q9NST1 481 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 CCDC167Q9P0B6 97 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 CIDEBQ9UHD4 219 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 SQORQ9Y6N5 450 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 NUP205Q92621 2012 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-210ENST00000480171 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms