RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	APOL1	O14791	398 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	CBFA2T3	O75081	653 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	MTA2	O94776	668 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	TRIM16	O95361	564 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	PCCB	P05166	539 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	ELFN1	P0C7U0	828 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	C6	P13671	934 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	MX2	P20592	715 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	SLC1A1	P43005	524 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	GALNT2	Q10471	571 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	ACOX1	Q15067	660 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	LLGL1	Q15334	1064 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	PGBD5	Q8N414	524 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	FAM71B	Q8TC56	605 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	RNF157	Q96PX1	679 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	PANX2	Q96RD6	677 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	SEMA3C	Q99985	751 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	TSPAN11	A1L157	253 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880		H3BM21	787 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	ENC1	O14682	589 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	TNFSF14	O43557	240 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	IGFALS	P35858	605 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	MMP12	P39900	470 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	RXRG	P48443	463 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	AP1B1	Q10567	949 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	DNAJC3	Q13217	504 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	PTK2B	Q14289	1009 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	LRRC14	Q15048	493 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	IRF4	Q15306	451 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	TCEA2	Q15560	299 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	KAZN	Q674X7	775 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	KIAA1328	Q86T90	577 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	PARG	Q86W56	976 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	PQLC3	Q8N755	202 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	KLK13	Q9UKR3	277 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	MYLK	Q15746	1914 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SSR4-208	ENST00000471880	KNTC1	P50748	2209 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	SOCS5	O75159	536 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	NDUFA10	O95299	355 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	PEX11B	O96011	259 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	ALPPL2	P10696	532 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	CCNB1	P14635	433 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	CTPS1	P17812	591 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	NFKBIA	P25963	317 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	EPHB1	P54762	984 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	14.89	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	SHC2	P98077	582 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	DAB2	P98082	770 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	DSC2	Q02487	901 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	TRAF2	Q12933	501 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	FAXC	Q5TGI0	409 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	NPNT	Q6UXI9	565 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	DAAM2	Q86T65	1068 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	MGME1	Q9BQP7	344 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	CEP41	Q9BYV8	373 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	DTL	Q9NZJ0	730 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	KCNK1	O00180	336 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	MATN3	O15232	486 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	JUND	P17535	347 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	DGKA	P23743	735 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	CCNC	P24863	283 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	ARHGEF7	Q14155	803 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	FZD2	Q14332	565 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SSR4-208	ENST00000471880	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		14.88	□□□□□ -0.03

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