RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463006.5

CNOT10-208, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 10, human

TSL 3

Gene CNOT10, Length 692 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	RNF144B	Q7Z419	303 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	NEK8	Q86SG6	692 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	HSCB	Q8IWL3	235 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	SETD6	Q8TBK2	473 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	UPB1	Q9UBR1	384 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	HAO1	Q9UJM8	370 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	PADI1	Q9ULC6	663 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	GABRQ	Q9UN88	632 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	PKP3	Q9Y446	797 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	QSOX1	O00391	747 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	DSCR3	O14972	297 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	HS6ST1	O60243	411 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	PRAMEF2	O60811	474 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	TMEM11	P17152	192 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	ENG	P17813	658 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	CERS1	P27544	350 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	GABRB2	P47870	512 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	AGTR2	P50052	363 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	GNAQ	P50148	359 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	TUBA4A	P68366	448 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	GPC5	P78333	572 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	CYP4A11	Q02928	519 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	ALCAM	Q13740	583 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	CRY2	Q49AN0	593 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	PCID2	Q5JVF3	399 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	CST9LP1	Q5W188	147 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	IYD	Q6PHW0	289 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006		Q6ZWC4	215 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	GLRX5	Q86SX6	157 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	LAS2	Q8IYD9	372 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	TMCO6	Q96DC7	493 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	USP29	Q9HBJ7	922 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006		A0A0U1RQK1	487 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF320	A2RRD8	509 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006		A6NL46	340 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	TTC34	A8MYJ7	566 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006		H0YAE9	185 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	SMIM22	K7EJ46	135 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	AP4M1	O00189	453 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	CHL1	O00533	1208 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	STX6	O43752	255 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	FMO6P	O60774	539 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	TPPP	O94811	219 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	C22orf31	O95567	290 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	ADA	P00813	363 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	FYN	P06241	537 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68

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