RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462721.5

DMKN-222, Transcript of dermokine, human

TSL 1 (best)

Gene DMKN, Length 970 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DMKN-222	ENST00000462721	MMP12	P39900	470 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	MMP13	P45452	471 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	THOP1	P52888	689 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	GALNT2	Q10471	571 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	AGER	Q15109	404 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	TCEAL1	Q15170	157 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	PROX2	Q3B8N5	592 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	HS1BP3	Q53T59	392 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	DHRS13	Q6UX07	377 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	PARG	Q86W56	976 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	TEX26	Q8N6G2	289 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	PQLC3	Q8N755	202 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	TC2N	Q8N9U0	490 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	OR4C6	Q8NH72	309 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	FAF2	Q96CS3	445 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	MGME1	Q9BQP7	344 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	ZNF670	Q9BS34	389 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	RBSN	Q9H1K0	784 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	KLF15	Q9UIH9	416 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	SPEG	Q15772	3267 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721		A8MX80	341 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	MATN3	O15232	486 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	FFAR2	O15552	330 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	JUND	P17535	347 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	CCNC	P24863	283 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	IGFALS	P35858	605 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	SLC1A1	P43005	524 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	MAGEA1	P43355	309 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	PEX5	P50542	639 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	MAX	P61244	160 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	INPP5A	Q14642	412 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	LRRC38	Q5VT99	294 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	LIPI	Q6XZB0	460 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	DPPA4	Q7L190	304 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	RFFL	Q8WZ73	363 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	SPOCK2	Q92563	424 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	TSGA13	Q96PP4	275 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	RNF157	Q96PX1	679 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	NT5M	Q9NPB1	228 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	11.3	□□□□□ -0.6	3e-6	■■■■□ 24.2
DMKN-222	ENST00000462721	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	PLXNA2	O75051	1894 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	FAM149A	A5PLN7	773 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721		H3BM21	787 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721		K7ESM1	405 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	MFSD11	O43934	449 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	SOCS5	O75159	536 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	RFPL3	O75679	317 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	NEBL	O76041	1014 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	MAP3K6	O95382	1288 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	ALPPL2	P10696	532 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	MX2	P20592	715 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	CES1	P23141	567 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	ACP1	P24666	158 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	ACADVL	P49748	655 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	E2F1	Q01094	437 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	GBE1	Q04446	702 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	ITK	Q08881	620 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	RALGDS	Q12967	914 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	ILK	Q13418	452 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	IRF4	Q15306	451 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	FAXC	Q5TGI0	409 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	CCNY	Q8ND76	341 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	LMX1A	Q8TE12	382 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	MAML1	Q92585	1016 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	FATE1	Q969F0	183 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	SEMA3C	Q99985	751 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	APOO	Q9BUR5	198 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	SPAST	Q9UBP0	616 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DMKN-222	ENST00000462721	LRRD1	A4D1F6	860 aa		11.28	□□□□□ -0.6

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