RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, human

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP4-208	ENST00000462602	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	SERPINB12	Q96P63	405 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	APOL2	Q9BQE5	337 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	HDAC8	Q9BY41	377 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	HACD3	Q9P035	362 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	MAGEB16	A2A368	324 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	TP73	O15350	636 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	USP12	O75317	370 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	PDHA1	P08559	390 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	AOC1	P19801	751 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	CXCL12	P48061	93 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	CCR3	P51677	355 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	NEK3	P51956	506 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	GAS6	Q14393	721 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	GALNT3	Q14435	633 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	TRADD	Q15628	312 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	HIF1A	Q16665	826 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	QPCT	Q16769	361 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	UGP2	Q16851	508 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	ERAP2	Q6P179	960 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	CENPU	Q71F23	418 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	TTC7B	Q86TV6	843 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	KBTBD6	Q86V97	674 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	GANC	Q8TET4	914 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	VOPP1	Q96AW1	172 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	LRRC39	Q96DD0	335 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	SCRN2	Q96FV2	425 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	FMO2	Q99518	471 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	OMD	Q99983	421 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	IL22	Q9GZX6	179 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	TRABD	Q9H4I3	376 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	CD248	Q9HCU0	757 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	SARDH	Q9UL12	918 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	NFU1	Q9UMS0	254 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602		A0A0J9YYE9	177 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	CAPN8	A6NHC0	703 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	MID1	O15344	667 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	SLC7A4	O43246	635 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	APBB3	O95704	486 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	CRTAM	O95727	393 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	TRBC1	P01850	177 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	ADRB3	P13945	408 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	TIMP2	P16035	220 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	GABRG2	P18507	467 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	NDUFV2	P19404	249 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	GRIA1	P42261	906 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	MAGEA3	P43357	314 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	CHRNA4	P43681	627 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	PDE1B	Q01064	536 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	ELP6	Q0PNE2	266 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	MTAP	Q13126	283 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	CBLB	Q13191	982 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	OLIG2	Q13516	323 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	ELF2	Q15723	593 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	BBS9	Q3SYG4	887 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	USP30	Q70CQ3	517 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZNF534	Q76KX8	674 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	CCNJL	Q8IV13	435 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	PGBD3	Q8N328	593 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	HMGB4	Q8WW32	186 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	ARRDC3	Q96B67	414 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SH3BP4-208	ENST00000462602	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		9.44	□□□□□ -0.9

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