RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459482.1

SNORD11.1-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 11, humanhuman

BASIC

Gene SNORD11, Length 85 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD11.1-201ENST00000459482 SPSB3Q6PJ21 355 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 LRRC8DQ7L1W4 858 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 TMTC1Q8IUR5 882 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 SPATA20Q8TB22 786 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 ADGRG7Q96K78 797 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 CDC14AQ9UNH5 594 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 CPED1A4D0V7 1026 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 SNAP23O00161 211 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 KDM4BO94953 1096 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 HEXAP06865 529 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 GPD2P43304 727 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 TUBP50607 506 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 GAS1P54826 345 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 DLG1Q12959 904 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 VEPH1Q14D04 833 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 KIF19Q2TAC6 998 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 SGO1Q5FBB7 561 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 CREB3L4Q8TEY5 395 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 RND1Q92730 232 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 HVCN1Q96D96 273 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 LRFN5Q96NI6 719 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 BBS4Q96RK4 519 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 SIN3AQ96ST3 1273 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 PKP4Q99569 1192 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 FUZQ9BT04 418 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 TKTL2Q9H0I9 626 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 RETREG1Q9H6L5 497 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 CARD8Q9Y2G2 431 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 PAM16Q9Y3D7 125 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 SNX9Q9Y5X1 595 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 NDUFS7O75251 213 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 CLDN14O95500 239 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 CYC1P08574 325 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 ETFAP13804 333 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 POU1F1P28069 291 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 UFM1P61960 85 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 TLE2Q04725 743 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 SNTA1Q13424 505 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 KLHL24Q6TFL4 600 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 HEATR4Q86WZ0 1026 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 ZNF354CQ86Y25 554 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 SLC35F3Q8IY50 421 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 HTRA1Q92743 480 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 APOPT1Q96IL0 206 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 KLHL15Q96M94 604 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 DOCK7Q96N67 2140 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 LRRC4Q9HBW1 653 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 SMYD2Q9NRG4 433 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa4.73□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 G6PDP11413 515 aa4.73□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 PCNAP12004 261 aa4.73□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 SHMT1P34896 483 aa4.73□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 CCT5P48643 541 aa4.73□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 RPP30P78346 268 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 TRPC3Q13507 836 aa4.73□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 MTSS1LQ765P7 747 aa4.73□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 FOXRED2Q8IWF2 684 aa4.73□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 CPXCR1Q8N123 301 aa4.73□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 SPATA22Q8NHS9 363 aa4.73□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 IGSF21Q96ID5 467 aa4.73□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 KCNN2Q9H2S1 579 aa4.73□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 KCNS2Q9ULS6 477 aa4.73□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP4.73□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 NFS1Q9Y697 457 aa4.73□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa4.72□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 TULP2O00295 520 aa4.72□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 SOCS6O14544 535 aa4.72□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 WNT9BO14905 357 aa4.72□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 SLC16A5O15375 505 aa4.72□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 PMS2P2O95744 297 aa4.72□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 AGAP20933 346 aa4.72□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP4.72□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 ITGADQ13349 1161 aa4.72□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
SNORD11.1-201ENST00000459482 C2orf68Q2NKX9 166 aa4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms