RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445667.6

USE1-202, Transcript of unconventional SNARE in the ER 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene USE1, Length 795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USE1-202ENST00000445667 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 TRIM38O00635 465 aa14.85□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 PIAS2O75928 621 aa14.85□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 DKK1O94907 266 aa14.85□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 MMP12P39900 470 aa14.85□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 NOP2P46087 812 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 GBE1Q04446 702 aa14.85□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 ITKQ08881 620 aa14.85□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 LRRC14Q15048 493 aa14.85□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 TCEAL1Q15170 157 aa14.85□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 IRF4Q15306 451 aa14.85□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 WSCD2Q2TBF2 565 aa14.85□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 TEX26Q8N6G2 289 aa14.85□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa14.85□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 MSRB2Q9Y3D2 182 aa14.85□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa14.85□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 MATN3O15232 486 aa14.84□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 FFAR2O15552 330 aa14.84□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 SIGLEC6O43699 453 aa14.84□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 LCA5LO95447 670 aa14.84□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 COMTP21964 271 aa14.84□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 CCNCP24863 283 aa14.84□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 TRAF2Q12933 501 aa14.84□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 RALGDSQ12967 914 aa14.84□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 PTPRRQ15256 657 aa14.84□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 FAM182AQ5T1J6 154 aa14.84□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 DHRS13Q6UX07 377 aa14.84□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 LIPIQ6XZB0 460 aa14.84□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 PARGQ86W56 976 aa14.84□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 MARCH9Q86YJ5 346 aa14.84□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 CCDC170Q8IYT3 715 aa14.84□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 GATA6Q92908 595 aa14.84□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 IFT43Q96FT9 208 aa14.84□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 GOLPH3Q9H4A6 298 aa14.84□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 DTLQ9NZJ0 730 aa14.84□□□□□ -0.03
USE1-202ENST00000445667 FAM221BA6H8Z2 402 aa14.83□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 SOWAHDA6NJG2 315 aa14.83□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 SPOPO43791 374 aa14.83□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 NEBLO76041 1014 aa14.83□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 CSF2P04141 144 aa14.83□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 KRT1P04264 644 aa14.83□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 GIMD1P0DJR0 217 aa14.83□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 JUNDP17535 347 aa14.83□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 SLC1A1P43005 524 aa14.83□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 THOP1P52888 689 aa14.83□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 YPEL5P62699 121 aa14.83□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 INPP5AQ14642 412 aa14.83□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 SPA17Q15506 151 aa14.83□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa14.83□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 DPPA4Q7L190 304 aa14.83□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 RHOT1Q8IXI2 618 aa14.83□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 PLD5Q8N7P1 536 aa14.83□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 CCNYQ8ND76 341 aa14.83□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 MAML1Q92585 1016 aa14.83□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 TSGA13Q96PP4 275 aa14.83□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 PANX2Q96RD6 677 aa14.83□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 SEMA3CQ99985 751 aa14.83□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 B4GALT6Q9UBX8 382 aa14.83□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 HEY1Q9Y5J3 304 aa14.83□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 ALG6Q9Y672 507 aa14.83□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 SHROOM3Q8TF72 1996 aa14.83□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 ANKRD36A6QL64 1941 aa14.82□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 CFAP69A5D8W1 941 aa14.82□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 SOCS5O75159 536 aa14.82□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 CPP00450 1065 aa14.82□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 PCCBP05166 539 aa14.82□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 ELFN1P0C7U0 828 aa14.82□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 MYF5P13349 255 aa14.82□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 CCNB1P14635 433 aa14.82□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 NME1P15531 152 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 CKMT2P17540 419 aa14.82□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 GM2AP17900 193 aa14.82□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 MX2P20592 715 aa14.82□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 CLDN6P56747 220 aa14.82□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 DSC2Q02487 901 aa14.82□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 PTK2BQ14289 1009 aa14.82□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 IHHQ14623 411 aa14.82□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 LLGL1Q15334 1064 aa14.82□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 PROX2Q3B8N5 592 aa14.82□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 RALGPS1Q5JS13 557 aa14.82□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 LRRC38Q5VT99 294 aa14.82□□□□□ -0.04
USE1-202ENST00000445667 MFSD7Q6UXD7 560 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms