RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 RBFAQ8N0V3 343 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 WDR48Q8TAF3 677 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 PEBP4Q96S96 227 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 U3KQA8 63 aa15.28■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 H3BRJ5 948 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 USP12O75317 370 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 CSO75390 466 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 GCATO75600 419 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 RASGRP1O95267 797 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 SKILP12757 684 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 NFKBIAP25963 317 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 MMP12P39900 470 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 SCNN1BP51168 640 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 HK3P52790 923 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 AP1S1P61966 158 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 C1orf61Q13536 156 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 NR1I3Q14994 352 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 WSCD2Q2TBF2 565 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 TBC1D25Q3MII6 688 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 AFMIDQ63HM1 303 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 LVRNQ6Q4G3 990 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 HID1Q8IV36 788 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 BBS5Q8N3I7 341 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 IQCDQ96DY2 449 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 ZNF599Q96NL3 588 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 LRRC61Q9BV99 259 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 BOCQ9BWV1 1114 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 ISCUQ9H1K1 167 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 CAAP1Q9H8G2 361 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 SEPT3Q9UH03 358 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 COQ6Q9Y2Z9 468 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa15.27■□□□□ 0.04
HERC3-206ENST00000431413 ATRXP46100 2492 aa15.27■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 A0A1W2PQ67 120 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 MUSKO15146 869 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 YY2O15391 372 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 TCEA3O75764 348 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 TSHRP16473 764 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 KELP23276 732 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 LSSP48449 732 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 GABREP78334 506 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 MTM1Q13496 603 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 ZNF235Q14590 738 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 INPP5AQ14642 412 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 LBRQ14739 615 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 NFATC4Q14934 902 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 IQCB1Q15051 598 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 ISXQ2M1V0 245 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 GUSBP11Q6P575 273 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 TMCO3Q6UWJ1 677 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 ENPP7Q6UWV6 458 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 RD3Q7Z3Z2 195 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 GKN2Q86XP6 184 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 NSMCE1Q8WV22 266 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 PSKH2Q96QS6 385 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 APOOQ9BUR5 198 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 TRIM7Q9C029 511 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 LAMA5O15230 3695 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 NBEAQ8NFP9 2946 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 A0A1W2PQJ5 194 aa15.25■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 MPOP05164 745 aa15.25■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 ELFN1P0C7U0 828 aa15.25■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 TGM2P21980 687 aa15.25■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 ITPKBP27987 946 aa15.25■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 SERPINB6P35237 376 aa15.25■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 RGRP47804 291 aa15.25■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 DPYSQ14117 519 aa15.25■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 DPYSL2Q16555 572 aa15.25■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 SLC35F3Q8IY50 421 aa15.25■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 NPWQ8N729 165 aa15.25■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 ZNF248Q8NDW4 579 aa15.25■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 ECHDC3Q96DC8 303 aa15.25■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 WDR92Q96MX6 357 aa15.25■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 LGMNQ99538 433 aa15.25■□□□□ 0.03
HERC3-206ENST00000431413 CLPBQ9H078 707 aa15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms