RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 ZBTB16Q05516 673 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 TRADDQ15628 312 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 SLC1A5Q15758 541 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 LRRC73Q5JTD7 316 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 SIRPB2Q5JXA9 342 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 FBXL19Q6PCT2 694 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 RANBP10Q6VN20 620 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 HOOK3Q86VS8 718 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 FBXL6Q8N531 539 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 AADATQ8N5Z0 425 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 DNAAF3Q8N9W5 541 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 MDGA1Q8NFP4 955 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 HCAR2Q8TDS4 363 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 PIH1D2Q8WWB5 315 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 OMDQ99983 421 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 SCML1Q9UN30 329 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 SHOC2Q9UQ13 582 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 APBB3O95704 486 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 FGF1P05230 155 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 GRIA1P42261 906 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 GRIA4P48058 902 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 NEK3P51956 506 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 DRG2P55039 364 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 CNTN1Q12860 1018 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 UGP2Q16851 508 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 TTC7BQ86TV6 843 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 NDUFAF2Q8N183 169 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 HDDC3Q8N4P3 179 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 TMEM105Q8N8V8 129 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 OR52K1Q8NGK4 314 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 SEC14L1Q92503 715 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 FAM114A2Q9NRY5 505 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 FBXL12Q9NXK8 326 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 GRHL1Q9NZI5 618 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 PHTF1Q9UMS5 762 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 EML5Q05BV3 1969 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 LRRK1Q38SD2 2015 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 KMT2EQ8IZD2 1858 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 UPK3BL1B0FP48 263 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 ANKRD66B4E2M5 251 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 UPK3BL2E5RIL1 263 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 PRKCGP05129 697 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 ADRB3P13945 408 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 CTPS1P17812 591 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 DRD3P35462 400 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 QPCTQ16769 361 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 MAMSTRQ6ZN01 415 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 MCUQ8NE86 351 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 IFT81Q8WYA0 676 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 SPOCK2Q92563 424 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 HDAC8Q9BY41 377 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 SMAPO00193 183 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 TIMP2P16035 220 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 NFKBIAP25963 317 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 P2RY2P41231 377 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 PLTPP55058 493 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC15Q0P6D6 951 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 CDH17Q12864 832 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 USP45Q70EL2 814 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 IFT20Q8IY31 132 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 CAMKK1Q8N5S9 505 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 EPC1Q9H2F5 836 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 SERGEFQ9UGK8 458 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 TRPM6Q9BX84 2022 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 A0A0J9YYE9 177 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 TP73O15350 636 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 TRBC1P01850 177 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 ALPIP09923 528 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 C7P10643 843 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 PXNP49023 591 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 MTM1Q13496 603 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP20.71■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 DENND5AQ6IQ26 1287 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 ERAP2Q6P179 960 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 LRRC8BQ6P9F7 803 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF534Q76KX8 674 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 KBTBD6Q86V97 674 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 ART4Q93070 314 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 SERPINB12Q96P63 405 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 SMIM14Q96QK8 99 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 TPSD1Q9BZJ3 242 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 ARNT2Q9HBZ2 717 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 PCDH12Q9NPG4 1184 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 CASS4Q9NQ75 786 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 GDF3Q9NR23 364 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXA4-202ENST00000428284 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXA4-202ENST00000428284 LAMTOR5O43504 91 aa20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms