RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR6C4Q8NGE1 309 aa13.29□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATL2Q8NHH9 583 aa13.29□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC30A5Q8TAD4 765 aa13.29□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HMCESQ96FZ2 354 aa13.29□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDXPQ96GD0 296 aa13.29□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM74Q96NL1 305 aa13.29□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APOOQ9BUR5 198 aa13.29□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GANQ9H2C0 597 aa13.29□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLQ9UEF7 1012 aa13.29□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RASA4BC9J798 803 aa13.28□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EFSO43281 561 aa13.28□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RASA4O43374 803 aa13.28□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCCBP05166 539 aa13.28□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LIPCP11150 499 aa13.28□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRT3P12035 628 aa13.28□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHRNB2P17787 502 aa13.28□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPD1P21695 349 aa13.28□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRP54P61011 504 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNC4Q03721 635 aa13.28□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTP4A2Q12974 167 aa13.28□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INPP5AQ14642 412 aa13.28□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AGERQ15109 404 aa13.28□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UGP2Q16851 508 aa13.28□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PARP15Q460N3 678 aa13.28□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EFHC2Q5JST6 749 aa13.28□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERAP2Q6P179 960 aa13.28□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM72Q6ZMU5 477 aa13.28□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NYAP1Q6ZVC0 841 aa13.28□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa13.28□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLFN11Q7Z7L1 901 aa13.28□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAAF5Q86Y56 855 aa13.28□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PYROXD2Q8N2H3 581 aa13.28□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HCAR2Q8TDS4 363 aa13.28□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDR92Q96MX6 357 aa13.28□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRN3Q9H3W5 708 aa13.28□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDH12Q9NPG4 1184 aa13.28□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PISDQ9UG56 409 aa13.28□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DACH1Q9UI36 760 aa13.28□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa13.28□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LOXL2Q9Y4K0 774 aa13.28□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR1A2Q9Y585 309 aa13.28□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa13.27□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOBOXO60393 691 aa13.27□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WISP1O95388 367 aa13.27□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 JMJD7P0C870 316 aa13.27□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UNGP13051 313 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MMP12P39900 470 aa13.27□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NSFP46459 744 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTM1Q13496 603 aa13.27□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERINC3Q13530 473 aa13.27□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRM3Q14832 879 aa13.27□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYTH1Q15438 398 aa13.27□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TGIF1Q15583 401 aa13.27□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCP11X2Q5H9J9 407 aa13.27□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCTD16Q68DU8 428 aa13.27□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCNJLQ8IV13 435 aa13.27□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EXD3Q8N9H8 876 aa13.27□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR156Q8NFN8 814 aa13.27□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SGF29Q96ES7 293 aa13.27□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP13.27□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SELENOOQ9BVL4 669 aa13.27□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SUV39H2Q9H5I1 410 aa13.27□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa13.27□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DGKBQ9Y6T7 804 aa13.27□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa13.27□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAST4O15021 2626 aa13.27□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WASH4PA8MWX3 477 aa13.26□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NVLO15381 856 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCP110O43303 1012 aa13.26□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CREB3O43889 395 aa13.26□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNFP01375 233 aa13.26□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SOX5P35711 763 aa13.26□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LIG3P49916 1009 aa13.26□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 JAM2P57087 298 aa13.26□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NFATC3Q12968 1075 aa13.26□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00303Q3SY05 128 aa13.26□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CERCAMQ5T4B2 595 aa13.26□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CFAP58Q5T655 872 aa13.26□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BRAT1Q6PJG6 821 aa13.26□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDR59Q6PJI9 974 aa13.26□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP53Q70EK8 1073 aa13.26□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa13.26□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C3orf20Q8ND61 904 aa13.26□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDHB18PQ96TA0 734 aa13.26□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM117AQ9C073 453 aa13.26□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLSTN2Q9H4D0 955 aa13.26□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDFQ9HBH1 243 aa13.26□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAB2Q9NYJ8 693 aa13.26□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAM22Q9P0K1 906 aa13.26□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APPL1Q9UKG1 709 aa13.26□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa13.26□□□□□ -0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms