RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPIL1Q9Y3C6 166 aa17.05■□□□□ 0.32
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TSHRP16473 764 aa17.04■□□□□ 0.32
TOP3BP1-201ENST00000420768 TPH1P17752 444 aa17.04■□□□□ 0.32
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TOP3BP1-201ENST00000420768 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP17.03■□□□□ 0.32
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ADH1BP00325 375 aa17.02■□□□□ 0.32
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TOP3BP1-201ENST00000420768 GSTA2P09210 222 aa17.02■□□□□ 0.32
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ZXDAP98168 799 aa17.02■□□□□ 0.32
TOP3BP1-201ENST00000420768 PDE1BQ01064 536 aa17.02■□□□□ 0.32
TOP3BP1-201ENST00000420768 POU6F1Q14863 301 aa17.02■□□□□ 0.32
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TOP3BP1-201ENST00000420768 UGP2Q16851 508 aa17.02■□□□□ 0.32
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SOX13Q9UN79 622 aa17.02■□□□□ 0.32
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TOP3BP1-201ENST00000420768 UNC80Q8N2C7 3258 aa17.02■□□□□ 0.31
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SATB1Q01826 763 aa17.02■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC15Q0P6D6 951 aa17.02■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 CST6Q15828 149 aa17.02■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 KYNUQ16719 465 aa17.02■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 DENND2CQ68D51 928 aa17.02■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 PKN3Q6P5Z2 889 aa17.02■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM135Q86UB9 458 aa17.02■□□□□ 0.31
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