RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411050.1

RN7SKP216-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 216, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP216, Length 312 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP216-201ENST00000411050 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 PARD6BQ9BYG5 372 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 LRRC2Q9BYS8 371 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 TSGA10Q9BZW7 698 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 DCLK3Q9C098 648 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 ZMYND12Q9H0C1 365 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 HSD3B7Q9H2F3 369 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 HAUS4Q9H6D7 363 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 MAGEF1Q9HAY2 307 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 LRTM1Q9HBL6 345 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP5□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 FANCLQ9NW38 375 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 EHD2Q9NZN4 543 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 GGA2Q9UJY4 613 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 MAN1B1Q9UKM7 699 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 SARDHQ9UL12 918 aa5□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 A0A1W2PQJ5 194 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 LRRC10BA6NIK2 292 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 A8MU76 341 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 BIN1O00499 593 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 PCDH17O14917 1159 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 XPOTO43592 962 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 STC2O76061 302 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 PLA2G4BP0C869 781 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 CD1CP29017 333 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 ALDH4A1P30038 563 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 USP8P40818 1118 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 TUBP50607 506 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 EFNA5P52803 228 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 MC2RQ01718 297 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 POU4F1Q01851 419 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 PNOCQ13519 176 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 STIM1Q13586 685 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 MAP7Q14244 749 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 NTRK3Q16288 839 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 RTN1Q16799 776 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 SHEQ5VZ18 495 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 GFRALQ6UXV0 394 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 GBP6Q6ZN66 633 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 C4orf50Q6ZRC1 276 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 HORMAD1Q86X24 394 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 MICU3Q86XE3 530 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 HIPK1Q86Z02 1210 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 PDILTQ8N807 584 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 DNAAF3Q8N9W5 541 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 FANCBQ8NB91 859 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 MCPH1Q8NEM0 835 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 PDZD8Q8NEN9 1154 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 OR6C4Q8NGE1 309 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 AZIN2Q96A70 460 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 PCED1BQ96HM7 432 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 SYT15Q9BQS2 421 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 FUT8Q9BYC5 575 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 SLC2A11Q9BYW1 496 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 ULBP3Q9BZM4 244 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 SLC13A1Q9BZW2 595 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 CCSER1Q9C0I3 900 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 RNF32Q9H0A6 362 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 NEUROD4Q9HD90 331 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 C1GALT1Q9NS00 363 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 OLAHQ9NV23 265 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 RWDD2AQ9UIY3 292 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 TINAGQ9UJW2 476 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 ADGRG1Q9Y653 693 aa4.99□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 SEC16AO15027 2179 aa4.98□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa4.98□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa4.98□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 hCG_1984214I3L0E3 225 aa4.98□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 SLC7A4O43246 635 aa4.98□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 MFAP3LO75121 409 aa4.98□□□□□ -1.61
RN7SKP216-201ENST00000411050 UNC5CO95185 931 aa4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56 ms