RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
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HERC3-202ENST00000402738 RPL38P63173 70 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 MERTKQ12866 999 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 MOGQ16653 247 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 IL23RQ5VWK5 629 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
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HERC3-202ENST00000402738 SLC34A3Q8N130 599 aa9.84□□□□□ -0.83
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HERC3-202ENST00000402738 Q96MT0 163 aa9.84□□□□□ -0.83
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HERC3-202ENST00000402738 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
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HERC3-202ENST00000402738 CASP7P55210 303 aa9.84□□□□□ -0.83
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HERC3-202ENST00000402738 ARMC8Q8IUR7 673 aa9.84□□□□□ -0.83
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HERC3-202ENST00000402738 ST14Q9Y5Y6 855 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa9.84□□□□□ -0.83
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HERC3-202ENST00000402738 ITM2AO43736 263 aa9.84□□□□□ -0.83
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HERC3-202ENST00000402738 NOS3P29474 1203 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 PTPN5P54829 565 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 MYBPC3Q14896 1274 aa9.84□□□□□ -0.83
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HERC3-202ENST00000402738 HHIPL2Q6UWX4 724 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 ZNF410Q86VK4 478 aa9.84□□□□□ -0.83
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HERC3-202ENST00000402738 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 SCUBE2Q9NQ36 999 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
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HERC3-202ENST00000402738 FAM172BPA6NC97 362 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 OR6C70A6NIJ9 312 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 ICAM1P05362 532 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 ATF6P18850 670 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 PPP2R1BP30154 601 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 CAPZA2P47755 286 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-202ENST00000402738 MAPKAPK2P49137 400 aa9.83□□□□□ -0.84
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