RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395833.7

LMO2-202, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 1,687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-202ENST00000395833 CAMK1DQ8IU85 385 aa29.61■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 CNPY4Q8N129 248 aa29.61■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 OR13J1Q8NGT2 312 aa29.61■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 GDAP1Q8TB36 358 aa29.61■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 SGSM3Q96HU1 749 aa29.61■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 GGT7Q9UJ14 662 aa29.61■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 ANKRD36A6QL64 1941 aa29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 LIMK2P53671 638 aa29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 SLC18A1P54219 525 aa29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 PRAMEP78395 509 aa29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 GEN1Q17RS7 908 aa29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 NEPROQ6NW34 567 aa29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 CNTN4Q8IWV2 1026 aa29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 OTUD6BQ8N6M0 293 aa29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 MYADMQ96S97 322 aa29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 CEP44Q9C0F1 390 aa29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 FBXO10Q9UK96 956 aa29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 ANKRD66B4E2M5 251 aa29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 COPEO14579 308 aa29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 GSRP00390 522 aa29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 GKP32189 559 aa29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 SLC8A1P32418 973 aa29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 ABCG1P45844 678 aa29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 TMPRSS15P98073 1019 aa29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 PDGFRLQ15198 375 aa29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 DLG2Q15700 870 aa29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 SH2D5Q6ZV89 423 aa29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 DENND6AQ8IWF6 608 aa29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 OR6P1Q8NGX9 317 aa29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 HDAC10Q969S8 669 aa29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 SMIM14Q96QK8 99 aa29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 PCMTD2Q9NV79 361 aa29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 CLDND1Q9NY35 253 aa29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 LMCD1Q9NZU5 365 aa29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 ERVW-1Q9UQF0 538 aa29.6■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 TRANK1O15050 2925 aa29.59■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 CCL22O00626 93 aa29.59■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 TIMM44O43615 452 aa29.59■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 TBX10O75333 385 aa29.59■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 ZWINTO95229 277 aa29.59■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 PGLSO95336 258 aa29.59■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 SLC4A1P02730 911 aa29.59■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 CCNFP41002 786 aa29.59■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 ARSDP51689 593 aa29.59■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 UGP2Q16851 508 aa29.59■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 TMEM215Q68D42 235 aa29.59■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 ZNF470Q6ECI4 717 aa29.59■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 C12orf40Q86WS4 652 aa29.59■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 CALML6Q8TD86 181 aa29.59■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa29.59■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 STYXQ8WUJ0 223 aa29.59■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 PEX13Q92968 403 aa29.59■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 S1PR5Q9H228 398 aa29.59■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 RABEP2Q9H5N1 569 aa29.59■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 TPP1O14773 563 aa29.58■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 FZD6O60353 706 aa29.58■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 CISD3P0C7P0 127 aa29.58■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 ABL2P42684 1182 aa29.58■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 MPP1Q00013 466 aa29.58■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 CTBP1Q13363 440 aa29.58■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 PTPRCAPQ14761 206 aa29.58■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 VITQ6UXI7 678 aa29.58■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 MICALCLQ6ZW33 695 aa29.58■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 YAF2Q8IY57 180 aa29.58■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 TCP10LQ8TDR4 215 aa29.58■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 DENND1AQ8TEH3 1009 aa29.58■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa29.58■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 MYLIPQ8WY64 445 aa29.58■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 E2F7Q96AV8 911 aa29.58■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 RIPOR3Q96MK2 946 aa29.58■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 CIPCQ9C0C6 399 aa29.58■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
LMO2-202ENST00000395833 SLC7A4O43246 635 aa29.57■■■□□ 2.32
LMO2-202ENST00000395833 SOCS5O75159 536 aa29.57■■■□□ 2.32
LMO2-202ENST00000395833 SIN3BO75182 1162 aa29.57■■■□□ 2.32
LMO2-202ENST00000395833 TULP3O75386 442 aa29.57■■■□□ 2.32
LMO2-202ENST00000395833 RPP40O75818 363 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
LMO2-202ENST00000395833 SERPINA4P29622 427 aa29.57■■■□□ 2.32
LMO2-202ENST00000395833 SLC1A2P43004 574 aa29.57■■■□□ 2.32
LMO2-202ENST00000395833 MYLK3Q32MK0 819 aa29.57■■■□□ 2.32
LMO2-202ENST00000395833 CARD16Q5EG05 197 aa29.57■■■□□ 2.32
LMO2-202ENST00000395833 HHATQ5VTY9 493 aa29.57■■■□□ 2.32
LMO2-202ENST00000395833 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
LMO2-202ENST00000395833 DCLK2Q8N568 766 aa29.57■■■□□ 2.32
LMO2-202ENST00000395833 OR13C4Q8NGS5 318 aa29.57■■■□□ 2.32
LMO2-202ENST00000395833 FAM83CQ9BQN1 747 aa29.57■■■□□ 2.32
LMO2-202ENST00000395833 EPN3Q9H201 632 aa29.57■■■□□ 2.32
LMO2-202ENST00000395833 MFSD1Q9H3U5 465 aa29.57■■■□□ 2.32
LMO2-202ENST00000395833 ECT2Q9H8V3 914 aa29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms