RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 INTUQ9ULD6 942 aa20.38■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 FFAR2O15552 330 aa20.37■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 KDELR1P24390 212 aa20.37■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 GARSP41250 739 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 THOP1P52888 689 aa20.37■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 IRF4Q15306 451 aa20.37■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 ST3GAL2Q16842 350 aa20.37■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 PQLC3Q8N755 202 aa20.37■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 NOD2Q9HC29 1040 aa20.37■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa20.37■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRD1A4D1F6 860 aa20.36■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM38O00635 465 aa20.36■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 SIGLEC6O43699 453 aa20.36■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 CSF2P04141 144 aa20.36■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 PROS1P07225 676 aa20.36■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 NME1P15531 152 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF75DP51815 510 aa20.36■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 RALGDSQ12967 914 aa20.36■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRC14Q15048 493 aa20.36■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 DHRS13Q6UX07 377 aa20.36■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 NT5MQ9NPB1 228 aa20.36■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 H3BM21 787 aa20.35■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 SOCS5O75159 536 aa20.35■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 MAGEA1P43355 309 aa20.35■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 ACADVLP49748 655 aa20.35■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 GBE1Q04446 702 aa20.35■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 PTK2BQ14289 1009 aa20.35■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 WSCD2Q2TBF2 565 aa20.35■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 DPPA4Q7L190 304 aa20.35■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa20.35■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 TEX26Q8N6G2 289 aa20.35■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 OR4C6Q8NH72 309 aa20.35■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRN4Q8WUT4 740 aa20.35■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 KLF15Q9UIH9 416 aa20.35■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa20.35■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 A8MX80 341 aa20.34■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 TOR1BO14657 336 aa20.34■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 RFPL3O75679 317 aa20.34■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 JUNDP17535 347 aa20.34■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 CKMT2P17540 419 aa20.34■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 YPEL5P62699 121 aa20.34■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 ITKQ08881 620 aa20.34■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 TRAF2Q12933 501 aa20.34■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 TCEAL1Q15170 157 aa20.34■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 PROX2Q3B8N5 592 aa20.34■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 HS1BP3Q53T59 392 aa20.34■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 RALGPS1Q5JS13 557 aa20.34■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa20.34■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 RNF157Q96PX1 679 aa20.34■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 SEMA3CQ99985 751 aa20.34■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 B4GALT6Q9UBX8 382 aa20.34■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 HYOU1Q9Y4L1 999 aa20.34■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A1W2PQ67 120 aa20.33■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 CFAP69A5D8W1 941 aa20.33■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 NEMP2A6NFY4 417 aa20.33■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 CPP00450 1065 aa20.33■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 KRT1P04264 644 aa20.33■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 PCCBP05166 539 aa20.33■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 C1SP09871 688 aa20.33■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 ELFN1P0C7U0 828 aa20.33■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 GIMD1P0DJR0 217 aa20.33■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 TNNT1P13805 278 aa20.33■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 MX2P20592 715 aa20.33■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 CCNCP24863 283 aa20.33■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC1A1P43005 524 aa20.33■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 AGERQ15109 404 aa20.33■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 LIPIQ6XZB0 460 aa20.33■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 MACC1Q6ZN28 852 aa20.33■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 GAS2L3Q86XJ1 694 aa20.33■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 RBFAQ8N0V3 343 aa20.33■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 GALNT15Q8N3T1 639 aa20.33■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 SPOCK2Q92563 424 aa20.33■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 MAML1Q92585 1016 aa20.33■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 TSGA13Q96PP4 275 aa20.33■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.33■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 NLGN3Q9NZ94 848 aa20.33■□□□□ 0.85
ANKRD39-201ENST00000393537 CEP295Q9C0D2 2601 aa20.33■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 SCAMP1O15126 338 aa20.32■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 MATN3O15232 486 aa20.32■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 NEBLO76041 1014 aa20.32■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 LCA5LO95447 670 aa20.32■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 ALPPL2P10696 532 aa20.32■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 COMTP21964 271 aa20.32■□□□□ 0.84
ANKRD39-201ENST00000393537 NOP2P46087 812 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms