RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392062.6

RHBDD1-202, Transcript of rhomboid domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RHBDD1, Length 5,151 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1-202ENST00000392062 LRRC72A6NJI9 287 aa9.51□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 INPPL1O15357 1258 aa9.51□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 GUCY1B2O75343 617 aa9.51□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 LONP2Q86WA8 852 aa9.51□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 KLHL23Q8NBE8 558 aa9.51□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 LMO3Q8TAP4 145 aa9.51□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa9.51□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 DPY30Q9C005 99 aa9.51□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 GKN1Q9NS71 199 aa9.51□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 MYO1CO00159 1063 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 TULP2O00295 520 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 RGS14O43566 566 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 DGKIO75912 1065 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 MLYCDO95822 493 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 ABCG1P45844 678 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 NRIP1P48552 1158 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 POLD2P49005 469 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 CXCR3P49682 368 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 CTBP1Q13363 440 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 DMC1Q14565 340 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 FBXL22Q6P050 247 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 RHBDF2Q6PJF5 856 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 PACS1Q6VY07 963 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 BPIFB1Q8TDL5 484 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 NPY6RQ99463 290 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 IL1RL2Q9HB29 575 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 ABCB8Q9NUT2 735 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 GPSM3Q9Y4H4 160 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 F8W810 466 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 HAS3O00219 553 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 USP1O94782 785 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 MTHFRP42898 656 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 GABRB2P47870 512 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 PSMD8P48556 350 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 PLK1P53350 603 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 RPS24P62847 133 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 TXNDC11Q6PKC3 985 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 DET1Q7L5Y6 550 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 KRT78Q8N1N4 520 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 ASZ1Q8WWH4 475 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 CEP295NLQ96MC4 621 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 FAM83DQ9H4H8 585 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 MAPRE3Q9UPY8 281 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 SNX10Q9Y5X0 201 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 TAF1P21675 1872 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 AMD1P17707 334 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 CCR3P51677 355 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 CDC16Q13042 620 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 CA9Q16790 459 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 PFKFB4Q16877 469 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 RASIP1Q5U651 963 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 TRIML2Q8N7C3 387 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 SLC22A17Q8WUG5 538 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 OTUB2Q96DC9 234 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 AVILO75366 819 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 PKMP14618 531 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 SERPINB5P36952 375 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 ACSM2AQ08AH3 577 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 ACSM2BQ68CK6 577 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 ICA1LQ8NDH6 482 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 GPR62Q9BZJ7 368 aa9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 KANSL1LA0AUZ9 987 aa9.49□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 ANKDD1BA6NHY2 528 aa9.49□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 E9PBE3 544 aa9.49□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 KLHL41O60662 606 aa9.49□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 WASP42768 502 aa9.49□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 CACNG1Q06432 222 aa9.49□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 NFYCQ13952 458 aa9.49□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 JADE3Q92613 823 aa9.49□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 AP2M1Q96CW1 435 aa9.49□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 FCRL5Q96RD9 977 aa9.49□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 TNKS2Q9H2K2 1166 aa9.49□□□□□ -0.89
RHBDD1-202ENST00000392062 TCAF1Q9Y4C2 921 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms