RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384540.1

RNU6-601P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 601, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-601P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZIC3O60481 467 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 NDUFS7O75251 213 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 CFC1BP0CG36 223 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 CFC1P0CG37 223 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 SRCP12931 536 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 CD58P19256 250 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 KCNA5P22460 613 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 FUT6P51993 359 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRKG1Q13976 671 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 HSPB2Q16082 182 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 SYT16Q17RD7 645 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 SOWAHAQ2M3V2 549 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 TUBB8Q3ZCM7 444 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM72AQ5TYM5 149 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM72DQ6L9T8 149 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM72BQ86X60 149 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 LURAP1LQ8IV03 231 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 CPXM2Q8N436 756 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 PARP16Q8N5Y8 322 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 KCNH5Q8NCM2 988 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 SPPL3Q8TCT6 385 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 ERGIC1Q969X5 290 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC39A13Q96H72 371 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM19Q96HH6 336 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 C3orf30Q96M34 536 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 DUX3Q96PT4 197 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 CLSTN3Q9BQT9 956 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 KLHL1Q9NR64 748 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZFP57Q9NU63 452 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 C1RLQ9NZP8 487 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 FEM1BQ9UK73 627 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 CDC14AQ9UNH5 594 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 A3GALT2U3KPV4 340 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 ARHGAP10A1A4S6 786 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 KLRF2D3W0D1 207 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 PER2O15055 1255 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 EDIL3O43854 480 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 CEP104O60308 925 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC22A3O75751 556 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 SERPINB2P05120 415 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 CNPP09543 421 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 CETPP11597 493 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 PCNAP12004 261 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 MARK3P27448 753 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 VEGFCP49767 419 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 NR1H2P55055 460 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 RUNX2Q13950 521 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRIM14Q14142 442 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 KRT72Q14CN4 511 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 ARHGEF6Q15052 776 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 POSTNQ15063 836 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 EDRF1Q3B7T1 1238 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 CES5AQ6NT32 575 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 C19orf48Q6RUI8 117 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 C17orf99Q6UX52 265 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 SATL1Q86VE3 508 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 WDSUB1Q8N9V3 476 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 USP38Q8NB14 1042 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 GJC3Q8NFK1 279 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 CEP70Q8NHQ1 597 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 LRRC8CQ8TDW0 803 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 AFG1LQ8WV93 481 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 TTC14Q96N46 770 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 EPHX3Q9H6B9 360 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 C17orf75Q9HAS0 396 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 PTPRHQ9HD43 1115 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 TCF19Q9Y242 345 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 TAF1P21675 1872 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 A0A1W2PS18 150 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 B9A039 149 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 C16orf97H3BN30 126 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 SOCS6O14544 535 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 ANP32CO43423 234 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 KLK8O60259 260 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZG16O60844 167 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 MTA2O94776 668 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 WEE2P0C1S8 567 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 STX2P32856 288 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 TIMP3P35625 211 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 CDKN1AP38936 164 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 UBE4AQ14139 1066 aa2.67□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms