RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380241.7

CTPS2-202, Transcript of CTP synthase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTPS2, Length 3,526 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2-202ENST00000380241 LTFP02788 710 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 IMPDH1P20839 514 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 PTGS2P35354 604 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 BNIP2Q12982 314 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 SQLEQ14534 574 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 PRPSAP1Q14558 356 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 ZACNQ401N2 412 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 FAM102BQ5T8I3 360 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 LIPMQ5VYY2 423 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 LDHDQ86WU2 507 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 SPPL2CQ8IUH8 684 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 FAM9CQ8IZT9 166 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 TRPV3Q8NET8 790 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 DCAF4Q8WV16 495 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 TTC9Q92623 222 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 RTP4Q96DX8 246 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 KIFC3Q9BVG8 833 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 AS3MTQ9HBK9 375 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 NECTIN3Q9NQS3 549 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 DIABLOQ9NR28 239 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 CCDC167Q9P0B6 97 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 ADAM28Q9UKQ2 775 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 DSEQ9UL01 958 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 VWA7Q9Y334 891 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 PSAT1Q9Y617 370 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 COL4A1P02462 1669 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 A0A096LPK6 155 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 GAS2O43903 313 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 LDLRP01130 860 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 MPOP05164 745 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 CCDC159P0C7I6 412 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 CRHBPP24387 322 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 MIPP30301 263 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 SPRP35270 261 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 DEFA1P59665 94 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 DEFA3P59666 94 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 ENPEPQ07075 957 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 POU6F1Q14863 301 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 GRTP1Q5TC63 336 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 FAM45BPQ6NSW5 357 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 GPAT2Q6NUI2 795 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 HORMAD1Q86X24 394 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 DEPDC4Q8N2C3 294 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 OR13J1Q8NGT2 312 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 FAM45AQ8TCE6 357 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 DSN1Q9H410 356 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 NPAP1Q9NZP6 1156 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 CCDC78A2IDD5 438 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 NRP2O60462 931 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 NDST3O95803 873 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 GPIP06744 558 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 ASNSP08243 561 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 NUDT1P36639 197 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 NAGLUP54802 743 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 BCAR1P56945 870 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 SIK1P57059 783 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 DUSP7Q16829 419 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 TMEM236Q5W0B7 351 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 LGI2Q8N0V4 545 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 FAM109AQ8N4B1 249 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 TTLL6Q8N841 843 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 ZNF516Q92618 1163 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 CPNE1Q99829 537 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 FTHL17Q9BXU8 183 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 B3GNT4Q9C0J1 378 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 CCDC90BQ9GZT6 254 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 ACSS2Q9NR19 701 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 GABARAPO95166 117 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 BMP1P13497 986 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 CTRB1P17538 263 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 ATP2B4P23634 1241 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 RARRES1P49788 294 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 CLCNKBP51801 687 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 LSM3P62310 102 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 GABPAQ06546 454 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 PITRM1Q5JRX3 1037 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 CTRB2Q6GPI1 263 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 TRAF7Q6Q0C0 670 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 ZNF534Q76KX8 674 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 PIGZQ86VD9 579 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS2-202ENST00000380241 OR6F1Q8NGZ6 308 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms