RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379435.3

TRBV20OR9-2-201, Transcript of T cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional), humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRBV20OR9-2, Length 416 nt, Biotype TR V gene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 FAM193AP78312 1265 aa13□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 NIPAL4Q0D2K0 466 aa13□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 ELP6Q0PNE2 266 aa13□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 IHHQ14623 411 aa13□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 STAT4Q14765 748 aa13□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 RALGPS1Q5JS13 557 aa13□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 CCDC181Q5TID7 509 aa13□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 BBS12Q6ZW61 710 aa13□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 UBL4BQ8N7F7 174 aa13□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 IL12RB2Q99665 862 aa13□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 RTKNQ9BST9 563 aa13□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 GAREM1Q9H706 876 aa13□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 IL21RQ9HBE5 538 aa13□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 AMACRQ9UHK6 382 aa13□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa13□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 DCDC2BA2VCK2 349 aa12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 A8MX80 341 aa12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 H0Y8X5 98 aa12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 RAD51BO15315 384 aa12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 OPHN1O60890 802 aa12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 CPP00450 1065 aa12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 CETN2P41208 172 aa12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 CTSKP43235 329 aa12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 SUOXP51687 545 aa12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 SGCGQ13326 291 aa12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 HLA-BQ31612 363 aa12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 TMEM52BQ4KMG9 183 aa12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 SLC45A4Q5BKX6 768 aa12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 ALG1LQ6GMV1 187 aa12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 ERAP2Q6P179 960 aa12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 CNTD1Q8N815 330 aa12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 MFSD2AQ8NA29 543 aa12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 TMEM145Q8NBT3 493 aa12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 ARRDC2Q8TBH0 407 aa12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 SKA1Q96BD8 255 aa12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 HES6Q96HZ4 224 aa12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 AGAP3Q96P47 875 aa12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 BRD8Q9H0E9 1235 aa12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 HAUS2Q9NVX0 235 aa12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 COQ6Q9Y2Z9 468 aa12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 RAI2Q9Y5P3 530 aa12.99□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa12.98□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 TLR4O00206 839 aa12.98□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 TM7SF2O76062 418 aa12.98□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 CER1O95813 267 aa12.98□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 APOC2P02655 101 aa12.98□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 PTMAP06454 111 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 PDHA1P08559 390 aa12.98□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 PTPN7P35236 360 aa12.98□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 MMP12P39900 470 aa12.98□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 LIG3P49916 1009 aa12.98□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 NOMO1Q15155 1222 aa12.98□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 ARMC12Q5T9G4 340 aa12.98□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 IL27RAQ6UWB1 636 aa12.98□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 GCNT7Q6ZNI0 430 aa12.98□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 ZSCAN30Q86W11 494 aa12.98□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 KLHDC7BQ96G42 594 aa12.98□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 FAM118BQ9BPY3 351 aa12.98□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 C10orf88Q9H8K7 445 aa12.98□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 B4GALT6Q9UBX8 382 aa12.98□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 PHTF1Q9UMS5 762 aa12.98□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 EFR3BQ9Y2G0 817 aa12.98□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 SPTBN2O15020 2390 aa12.97□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 A0A1W2PQ67 120 aa12.97□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 POM121BA6NF01 834 aa12.97□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 GOLGA8CPA6NN73 597 aa12.97□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 H7C0C1 242 aa12.97□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 TM4SF5O14894 197 aa12.97□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 FZD6O60353 706 aa12.97□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 TJP3O95049 919 aa12.97□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 PGLSO95336 258 aa12.97□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 MMP2P08253 660 aa12.97□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 THEGLP0DJG4 465 aa12.97□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 C6P13671 934 aa12.97□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 CTPS1P17812 591 aa12.97□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 CES1P23141 567 aa12.97□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 PTPN3P26045 913 aa12.97□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 CD86P42081 329 aa12.97□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 ATP5OP48047 213 aa12.97□□□□□ -0.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 NXPH1P58417 271 aa12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms