RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 SMYD2Q9NRG4 433 aa17.89■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP17.89■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 ARL5AQ9Y689 179 aa17.89■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 XIRP2A4UGR9 3374 aa17.89■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 FZD6O60353 706 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 SYF2O95926 243 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 F7P08709 466 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 ALPIP09923 528 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 ADRA1DP25100 572 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 IL12RB1P42701 662 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 SEMG2Q02383 582 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 RAD51Q06609 339 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 PTPRCAPQ14761 206 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 LRRC73Q5JTD7 316 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 CCNJLQ8IV13 435 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 HEPHQ9BQS7 1158 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 CCDC77Q9BR77 488 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 WASF2Q9Y6W5 498 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 ANKRD36A6QL64 1941 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 HEATR9A2RTY3 570 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 GOLGA6L10A6NI86 522 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 GOLGA8KD6RF30 607 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 GOLGA8TH3BQL2 631 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 AURKAO14965 403 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 SOCS5O75159 536 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 SIN3BO75182 1162 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 USP1O94782 785 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 CTSLP07711 333 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 GSTA2P09210 222 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 MYZAPP0CAP1 466 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 ERVK-10P10266 1014 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 ALADP13716 330 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 TMPRSS15P98073 1019 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 ARSIQ5FYB1 569 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 TMEM135Q86UB9 458 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 RASSF3Q86WH2 238 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 STK40Q8N2I9 435 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 PPM1NQ8N819 430 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 PIH1D2Q8WWB5 315 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 KLHL32Q96NJ5 620 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 TBK1Q9UHD2 729 aa17.88■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 MAGEB16A2A368 324 aa17.87■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 ANKRD66B4E2M5 251 aa17.87■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 OPA1O60313 960 aa17.87■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 UGT1A9O60656 530 aa17.87■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 LEFTY1O75610 366 aa17.87■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 C1QAP02745 245 aa17.87■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 IVLP07476 585 aa17.87■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 GCAP28676 217 aa17.87■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 KLHL38Q2WGJ6 581 aa17.87■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 TTMPQ5BVD1 217 aa17.87■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 TSTD2Q5T7W7 516 aa17.87■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 KCTD16Q68DU8 428 aa17.87■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 GDPD4Q6W3E5 623 aa17.87■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 CERS2Q96G23 380 aa17.87■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 CYTH2Q99418 400 aa17.87■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 PAFAH2Q99487 392 aa17.87■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 SH3GL2Q99962 352 aa17.87■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 SUV39H2Q9H5I1 410 aa17.87■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 UGT1A7Q9HAW7 530 aa17.87■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 UGT1A10Q9HAW8 530 aa17.87■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 UGT1A8Q9HAW9 530 aa17.87■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 IL36AQ9UHA7 158 aa17.87■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 A8MX80 341 aa17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 FOXO6A8MYZ6 492 aa17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 FAM155BO75949 473 aa17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 EGFP01133 1207 aa17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 TIE1P35590 1138 aa17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 VASPP50552 380 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 TMED2Q15363 201 aa17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 CNGA3Q16281 694 aa17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 HSP90B2PQ58FF3 399 aa17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 MDGA1Q8NFP4 955 aa17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 DNASE1L2Q92874 299 aa17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 RANBP9Q96S59 729 aa17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 TMEM245Q9H330 911 aa17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 TMBIM4Q9HC24 238 aa17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 PRKAG3Q9UGI9 489 aa17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 FAM169AQ9Y6X4 670 aa17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 EYSQ5T1H1 3165 aa17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 FAM159BA6NKW6 160 aa17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 K7EQS6 105 aa17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 LDB2O43679 373 aa17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 VAPBO95292 243 aa17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms