RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 CNTN1Q12860 1018 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 MYLK3Q32MK0 819 aa4.47□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 MRNIPQ6NTE8 343 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CYB5D1Q6P9G0 228 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 RFX8Q6ZV50 586 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 HORMAD1Q86X24 394 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 GALNT15Q8N3T1 639 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 KCNN1Q92952 543 aa4.47□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 DUSP23Q9BVJ7 150 aa4.47□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 VPS51Q9UID3 782 aa4.47□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 C16orf96A6NNT2 1141 aa4.47□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 MPSTP25325 297 aa4.47□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 ACSL1P33121 698 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ACVRL1P37023 503 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TPMTP51580 245 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 ENC1O14682 589 aa4.47□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 USP12O75317 370 aa4.47□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 GZMAP12544 262 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 HNF4AP41235 474 aa4.47□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 ETF1P62495 437 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 CEP128Q6ZU80 1094 aa4.47□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 FAM71AQ8IYT1 594 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 APCDD1Q8J025 514 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 FAM71DQ8N9W8 422 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 MDGA1Q8NFP4 955 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 STK32AQ8WU08 396 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 NUS1Q96E22 293 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CNDP1Q96KN2 507 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CEP295NLQ96MC4 621 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 COPS8Q99627 209 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 FAM83CQ9BQN1 747 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 OR2AG1Q9H205 316 aa4.47□□□□□ -1.69
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