RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345807.6

CLTB-202, Transcript of clathrin light chain B, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLTB, Length 1,161 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTB-202ENST00000345807 HID1Q8IV36 788 aa22.89■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 SPACA3Q8IXA5 215 aa22.89■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 ZNF248Q8NDW4 579 aa22.89■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa22.89■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 AIPL1Q9NZN9 384 aa22.89■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa22.89■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 SMTNL1A8MU46 457 aa22.88■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 DFFAO00273 331 aa22.88■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 PRKCGP05129 697 aa22.88■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 GZMAP12544 262 aa22.88■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 HTR1BP28222 390 aa22.88■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 SERPINA4P29622 427 aa22.88■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 MIPP30301 263 aa22.88■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 HK3P52790 923 aa22.88■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 INPP5AQ14642 412 aa22.88■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 ENPP7Q6UWV6 458 aa22.88■■□□□ 1.25
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CLTB-202ENST00000345807 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa22.88■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 FNIP1Q8TF40 1166 aa22.88■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 NAT6Q93015 286 aa22.88■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
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CLTB-202ENST00000345807 LGMNQ99538 433 aa22.88■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 APOOQ9BUR5 198 aa22.88■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
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CLTB-202ENST00000345807 DOLKQ9UPQ8 538 aa22.88■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 ASXL3Q9C0F0 2248 aa22.88■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
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CLTB-202ENST00000345807 PRKCIP41743 596 aa22.87■■□□□ 1.25
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CLTB-202ENST00000345807 NFATC4Q14934 902 aa22.87■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 AGERQ15109 404 aa22.87■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 ELOCQ15369 112 aa22.87■■□□□ 1.25
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CLTB-202ENST00000345807 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa22.87■■□□□ 1.25
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CLTB-202ENST00000345807 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.255e-12■■■■□ 26.4
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CLTB-202ENST00000345807 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
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CLTB-202ENST00000345807 RD3Q7Z3Z2 195 aa22.86■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 ATL2Q8NHH9 583 aa22.86■■□□□ 1.25
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CLTB-202ENST00000345807 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa22.86■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 SCINQ9Y6U3 715 aa22.86■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa22.85■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 CFAP69A5D8W1 941 aa22.85■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 HCAR3P49019 387 aa22.85■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 SRP54P61011 504 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
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CLTB-202ENST00000345807 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
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CLTB-202ENST00000345807 MYO1AQ9UBC5 1043 aa22.85■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 KLQ9UEF7 1012 aa22.85■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 SHROOM3Q8TF72 1996 aa22.85■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 A0A1B0GTH6 734 aa22.84■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CLTB-202ENST00000345807 CASC3O15234 703 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
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