RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 C2orf71A6NGG8 1288 aa20.83■□□□□ 0.93
NISCH-201ENST00000345716 TRIM38O00635 465 aa20.83■□□□□ 0.93
NISCH-201ENST00000345716 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
NISCH-201ENST00000345716 RPN2P04844 631 aa20.83■□□□□ 0.93
NISCH-201ENST00000345716 SP100P23497 879 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
NISCH-201ENST00000345716 MPSTP25325 297 aa20.83■□□□□ 0.93
NISCH-201ENST00000345716 GABRR2P28476 465 aa20.83■□□□□ 0.93
NISCH-201ENST00000345716 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
NISCH-201ENST00000345716 MYRFQ9Y2G1 1151 aa20.83■□□□□ 0.93
NISCH-201ENST00000345716 YJEFN3A6XGL0 299 aa20.83■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 HTR7P34969 479 aa20.83■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 FAM187BQ17R55 369 aa20.83■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 STARD8Q92502 1023 aa20.83■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 SEPT4O43236 478 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 HPCAL1P37235 193 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 OR6K2Q8NGY2 324 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 PPP3R2Q96LZ3 170 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 RAD18Q9NS91 495 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 KRT84Q9NSB2 600 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 DTLQ9NZJ0 730 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 SNTNA6NMZ2 147 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 ANPEPP15144 967 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 CREB1P16220 341 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 FAM151BQ6UXP7 276 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 LPCAT2Q7L5N7 544 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 PPM1AP35813 382 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 DEFA1P59665 94 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 DEFA3P59666 94 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 CYP2A13Q16696 494 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 HECTD2Q5U5R9 776 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 CUZD1Q86UP6 607 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 TWNKQ96RR1 684 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 ZFP14Q9HCL3 533 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 ADPRHL2Q9NX46 363 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 IL1R2P27930 398 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 CTNNB1P35222 781 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 BBS2Q9BXC9 721 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 ROGDIQ9GZN7 287 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 SCN11AQ9UI33 1791 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 EPN2O95208 641 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 ATG7O95352 703 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 LINC00032P0C843 101 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 COL6A2P12110 1019 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 TACR2P21452 398 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 PAGE2BQ5JRK9 111 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 DHDDSQ86SQ9 333 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 FBXO30Q8TB52 745 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 PPP1R16AQ96I34 528 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 C7orf26Q96N11 449 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 IGFLR1Q9H665 355 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 TRAF6Q9Y4K3 522 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 EFCAB14O75071 495 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 GLUD2P49448 558 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 LIMK2P53671 638 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 TERB1Q8NA31 727 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 TADA1Q96BN2 335 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 FBXW11Q9UKB1 542 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 AP3M1Q9Y2T2 418 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 KPNA5O15131 536 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 RPP40O75818 363 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 SPATA31D3P0C874 917 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 TCF4P15884 667 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 CDC25CP30307 473 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 RPL38P63173 70 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 DSC2Q02487 901 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 GRM3Q14832 879 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 ISLR2Q6UXK2 745 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 ZNF276Q8N554 614 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 FITM2Q8N6M3 262 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 OR4K2Q8NGD2 314 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 SLC35B2Q8TB61 432 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 SLC9A7Q96T83 725 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 TRMOQ9BU70 441 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 ARHGEF9O43307 516 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 TMEM63AO94886 807 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 OTCP00480 354 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 MFSD4BQ5TF39 518 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 RFWD3Q6PCD5 774 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 NXNL1Q96CM4 212 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 MAGEC1O60732 1142 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
NISCH-201ENST00000345716 ATL1Q8WXF7 558 aa20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms