RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC9A7Q96T83 725 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 C9orf16Q9BUW7 83 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 LTBP3Q9NS15 1303 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 NDUFB5O43674 189 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP6V1G2O95670 118 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 CLPTM1O96005 669 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 NOS3P29474 1203 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 CDYL2Q8N8U2 506 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 CD101Q93033 1021 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 APOL4Q9BPW4 351 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 DUSP12Q9UNI6 340 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 MYBL2P10244 700 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 CRHR2Q13324 411 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 FGD3Q5JSP0 725 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 BHLHB9Q6PI77 547 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 TRABD2AQ86V40 505 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 DTNBP1Q96EV8 351 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 APODP05090 189 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 ZCCHC18P0CG32 403 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 MAPKAPK2P49137 400 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 MAPKAPK3Q16644 382 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 SNX30Q5VWJ9 437 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 NAT16Q8N8M0 369 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 MAGEH1Q9H213 219 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 ASF1AQ9Y294 204 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 PMM2O15305 246 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 CLOCKO15516 846 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 RGS5O15539 181 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 RPP40O75818 363 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 ACLYP53396 1101 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 PRKG2Q13237 762 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 CERCAMQ5T4B2 595 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 EXOC3L1Q86VI1 746 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 AADATQ8N5Z0 425 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 NETO2Q8NC67 525 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 SOHLH2Q9NX45 425 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 Q9Y3F1 56 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 FFAR3O14843 346 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 GPR42O15529 346 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM58BPP0C7Q3 252 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 DAOAP59103 153 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 TCEA2Q15560 299 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 ALFQ53S48 1182 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 CERS6Q6ZMG9 384 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM139Q8IV31 216 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 CLYBLQ8N0X4 340 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 TBCDQ9BTW9 1192 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 ROGDIQ9GZN7 287 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 AZIN1O14977 448 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 LRIG2O94898 1065 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 CDH4P55283 916 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 ARHGAP1Q07960 439 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 XKR6Q5GH73 641 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 OR6K2Q8NGY2 324 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 TFAP2BQ92481 460 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 VMP1Q96GC9 406 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 ARHGEF4Q9NR80 690 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 MYBPHLA2RUH7 354 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 PIGRP01833 764 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 ELP6Q0PNE2 266 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 ABRQ12979 859 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 RNF43Q68DV7 783 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 ASZ1Q8WWH4 475 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 ANAPC2Q9UJX6 822 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 HGFP14210 728 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 GNA12Q03113 381 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 GDPD5Q8WTR4 605 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 RAI2Q9Y5P3 530 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 COL6A2P12110 1019 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 UQCRBP14927 111 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 TAC4Q86UU9 113 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 GBA3Q9H227 469 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 REEP1Q9H902 201 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 COG5Q9UP83 839 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 C2CD4BA6NLJ0 364 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 H3BN98 237 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 SERPINI2O75830 405 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 PKMP14618 531 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 ADSSP30520 456 aa16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms