RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 LINC01553A4QN01 128 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 FGF19O95750 216 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 SERPINE1P05121 402 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 APOA4P06727 396 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 DLDP09622 509 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 STMN1P16949 149 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 CRABP2P29373 138 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 CCR2P41597 374 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 CLCN5P51795 746 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 EPHA5P54756 1037 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 POU4F1Q01851 419 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 BNIP1Q12981 228 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 BHMTQ93088 406 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 LRRC37BQ96QE4 947 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 KCNK13Q9HB14 408 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 NMRAL1Q9HBL8 299 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 RAI2Q9Y5P3 530 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 CAPN7Q9Y6W3 813 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 A0A0G2JND7 137 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 AURKAO14965 403 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 RPP40O75818 363 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 PRLP01236 227 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 AVPR1AP37288 418 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 CNSTQ6PJW8 725 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC91Q7Z6B0 441 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 CRLF3Q8IUI8 442 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 GPATCH11Q8N954 259 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 SHKBP1Q8TBC3 707 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 STYXQ8WUJ0 223 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 MYLK2Q9H1R3 596 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 MID2Q9UJV3 735 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC85CA6NKD9 419 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 CCL22O00626 93 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 HGSO14964 777 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 PIRTP0C851 137 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 GRK2P25098 689 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 ARFIP2P53365 341 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 NCEH1Q6PIU2 408 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 CEP97Q8IW35 865 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 PPM1EQ8WY54 764 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 RMDN1Q96DB5 314 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 TBATAQ96M53 351 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 C17orf80Q9BSJ5 609 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 ACOT9Q9Y305 439 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 CRTAMO95727 393 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP26.94■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 TAS2R39P59534 338 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 C9orf50Q5SZB4 431 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 GPR158Q5T848 1215 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 TNS4Q8IZW8 715 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 MICALL1Q8N3F8 863 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 ERP27Q96DN0 273 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 C20orf27Q9GZN8 174 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 MAN1C1Q9NR34 630 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 SPO11Q9Y5K1 396 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 RHOAP61586 193 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF789Q5FWF6 425 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 RALGPS1Q5JS13 557 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 RDH11Q8TC12 318 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 OMDQ99983 421 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 TASP1Q9H6P5 420 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 ANKRD36A6QL64 1941 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 A0A087X1B8 175 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 C5orf67F2Z3F1 127 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 G3V2L1 256 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 RALBP11234 206 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 SLC12A2P55011 1212 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 LPCAT1Q8NF37 534 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 OR13C4Q8NGS5 318 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 GPR150Q8NGU9 434 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 KCTD4Q8WVF5 259 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 ADGRE3Q9BY15 652 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 OR51F1A6NGY5 319 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 BUD23O43709 281 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 RFPL2O75678 378 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 GOT2P00505 430 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 PTPN2P17706 415 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 PGGT1BP53609 377 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 TRAF2Q12933 501 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 PTPRCAPQ14761 206 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 RETSATQ6NUM9 610 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXD8-201ENST00000313173 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms