RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255198.2

ZBED3-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED3, Length 6,172 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-201ENST00000255198 LRCH1Q9Y2L9 728 aa20.56■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 CXCL11O14625 94 aa20.56■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 CDKAL1Q5VV42 579 aa20.56■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 FIBCD1Q8N539 461 aa20.56■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 CHADO15335 359 aa20.56■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 CERS2Q96G23 380 aa20.56■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 ALKBH4Q9NXW9 302 aa20.56■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 CORO2BQ9UQ03 480 aa20.56■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 AP3M1Q9Y2T2 418 aa20.56■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 CD163L1Q9NR16 1453 aa20.56■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 AREL1O15033 823 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 NR1D2Q14995 579 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 MED22Q15528 200 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 CAMK1DQ8IU85 385 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 KATNAL2Q8IYT4 538 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 STK32AQ8WU08 396 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 LINGO1Q96FE5 620 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 PPP3R2Q96LZ3 170 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 MTFR1LQ9H019 292 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 C1orf167Q5SNV9 1468 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 SEC23AQ15436 765 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 BROXQ5VW32 411 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 TET3O43151 1660 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 MAGEB3O15480 346 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 IQSEC1Q6DN90 963 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 TSPAN14Q8NG11 270 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 CLTCL1P53675 1640 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 SALL1Q9NSC2 1324 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 IGFALSP35858 605 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 GPER1Q99527 375 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 IL17RBQ9NRM6 502 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 TMCO1Q9UM00 188 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 GNRH1P01148 92 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP20.55■□□□□ 0.885e-6■■■□□ 17.5
ZBED3-201ENST00000255198 UGT1A5P35504 534 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 PSME3P61289 254 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 CTBP1Q13363 440 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 NOMO2Q5JPE7 1267 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 FBXW8Q8N3Y1 598 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 UROC1Q96N76 676 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 CHID1Q9BWS9 393 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 SHBGP04278 402 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 PPP2R2BQ00005 443 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 PTCHD4Q6ZW05 846 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 OR10H5Q8NGA6 315 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 RELTQ969Z4 430 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 L2HGDHQ9H9P8 463 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 S100A9P06702 114 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 GOT1P17174 413 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 CLCN5P51795 746 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 MAMLD1Q13495 774 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF697Q5TEC3 545 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 PLPP4Q5VZY2 271 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 OSER1Q9NX31 292 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 GIT1Q9Y2X7 761 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 FFAR2O15552 330 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 SLC26A3P40879 764 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 SEMA5AQ13591 1074 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 SPAG4Q9NPE6 437 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 LYNP07948 512 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 MC4RP32245 332 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 CHN2P52757 468 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 TMEM119Q4V9L6 283 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 CLHC1Q8NHS4 586 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 SLC4A9Q96Q91 983 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 KCNQ5Q9NR82 932 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 CLIC5Q9NZA1 410 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 WNT10BO00744 389 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 GCATO75600 419 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 ADSSP30520 456 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 RAB10P61026 200 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 MAP4K3Q8IVH8 894 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 MAB21L3Q8N8X9 362 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 PIH1D2Q8WWB5 315 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED3-201ENST00000255198 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms