RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM86C2PA6NEL3 165 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-201ENST00000246533 BUD23O43709 281 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-201ENST00000246533 GREM1O60565 184 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-201ENST00000246533 MLNP12872 115 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-201ENST00000246533 SOX9P48436 509 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-201ENST00000246533 NR2C2P49116 596 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-201ENST00000246533 ASPHQ12797 758 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-201ENST00000246533 INSCQ1MX18 579 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-201ENST00000246533 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-201ENST00000246533 DHDDSQ86SQ9 333 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXO27Q8NI29 283 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-201ENST00000246533 C11orf16Q9NQ32 467 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-201ENST00000246533 MOCS1Q9NZB8 636 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-201ENST00000246533 NCAM1P13591 858 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 PRDX6P30041 224 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 CLCN2P51788 898 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 SNX16P57768 344 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 BTKQ06187 659 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 STEAP4Q687X5 459 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHDC10Q6PID8 442 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 UBALD2Q8IYN6 164 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 CMTM5Q96DZ9 223 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 HPS4Q9NQG7 708 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 MARCH2Q9P0N8 246 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP3K13O43283 966 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 ALDH1A2O94788 518 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 BAG2O95816 211 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 CD72P21854 359 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 IL4RP24394 825 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 L1CAMP32004 1257 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 COPAP53621 1224 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 NRLP54845 237 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 POLE2P56282 527 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 RABGAP1LQ5R372 815 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 CES4AQ5XG92 561 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM67Q6ZTA4 783 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 PDSS2Q86YH6 399 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 PQLC3Q8N755 202 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP4R1Q8TF05 950 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 CDKL2Q92772 493 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 TTC1Q99614 292 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFA13Q9P0J0 144 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa26.57■■□□□ 1.84
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CAPNS1-201ENST00000246533 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 TUBB3Q13509 450 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 BMPR2Q13873 1038 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 MBLAC2Q68D91 279 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC33Q8N5R6 958 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 PHC3Q8NDX5 983 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 OR6Y1Q8NGX8 325 aa26.56■■□□□ 1.84
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CAPNS1-201ENST00000246533 RNF139Q8WU17 664 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDH18Q9HCL0 1135 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC12A8A0AV02 714 aa26.55■■□□□ 1.84
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CAPNS1-201ENST00000246533 KITP10721 976 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC6A3Q01959 620 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 BBS7Q8IWZ6 715 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 SIX5Q8N196 739 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXL21Q9UKT6 434 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 COL4A2P08572 1712 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 STC2O76061 302 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 SIGLEC14Q08ET2 396 aa26.55■■□□□ 1.84
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CAPNS1-201ENST00000246533 CUL3Q13618 768 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 MROH9Q5TGP6 573 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 PGM2L1Q6PCE3 622 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 DEFB106AQ8N104 65 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 IRF7Q92985 503 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 NAT9Q9BTE0 207 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 SPATA16Q9BXB7 569 aa26.55■■□□□ 1.84
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CAPNS1-201ENST00000246533 PPM1HQ9ULR3 514 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 TCF3P15923 654 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC1A6P48664 564 aa26.54■■□□□ 1.84
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CAPNS1-201ENST00000246533 LIN52Q52LA3 116 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC44A4Q53GD3 710 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 DCAF6Q58WW2 860 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 TRNP1Q6NT89 227 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 RASSF3Q86WH2 238 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDH19Q8TAB3 1148 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
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CAPNS1-201ENST00000246533 CHFRQ96EP1 664 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 CLPTM1LQ96KA5 538 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
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