RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000155840.9

KCNQ1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 3,245 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-201ENST00000155840 ARNTP27540 789 aa17.46■□□□□ 0.39
KCNQ1-201ENST00000155840 CTBSQ01459 385 aa17.46■□□□□ 0.39
KCNQ1-201ENST00000155840 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa17.46■□□□□ 0.39
KCNQ1-201ENST00000155840 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
KCNQ1-201ENST00000155840 THAP11Q96EK4 314 aa17.46■□□□□ 0.39
KCNQ1-201ENST00000155840 MID1IP1Q9NPA3 183 aa17.46■□□□□ 0.39
KCNQ1-201ENST00000155840 OLAHQ9NV23 265 aa17.46■□□□□ 0.39
KCNQ1-201ENST00000155840 ACTL7AQ9Y615 435 aa17.46■□□□□ 0.39
KCNQ1-201ENST00000155840 H6PDO95479 791 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 SMPD1P17405 629 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 ACADSBP45954 432 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 BRCC3P46736 316 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 CD151P48509 253 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 CLCNKBP51801 687 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 STXBP5Q5T5C0 1151 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 METTL21CQ5VZV1 264 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 AHI1Q8N157 1196 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 SENP8Q96LD8 212 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 SMOXQ9NWM0 555 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 CRCPO75575 148 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 HLA-DQB2P05538 268 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 CDK18Q07002 472 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 AAK1Q2M2I8 961 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 PKN3Q6P5Z2 889 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 NLGN2Q8NFZ4 835 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC39A8Q9C0K1 460 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 TRAF6Q9Y4K3 522 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 NRP2O60462 931 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 ARSDP51689 593 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 DIO3P55073 304 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 ARL13BQ3SXY8 428 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 EXOC8Q8IYI6 725 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 FIBCD1Q8N539 461 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 SHCBP1Q8NEM2 672 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 HDAC10Q969S8 669 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 SPAG4Q9NPE6 437 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 ANK1P16157 1881 aa17.44■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 UBXN8O00124 270 aa17.44■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 DAB1O75553 588 aa17.44■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 CD86P42081 329 aa17.44■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 STX1BP61266 288 aa17.44■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 CYP51A1Q16850 503 aa17.44■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 FGD3Q5JSP0 725 aa17.44■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 ZFP1Q6P2D0 407 aa17.44■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 PDZD8Q8NEN9 1154 aa17.44■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 ZMIZ2Q8NF64 920 aa17.44■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 GIPC3Q8TF64 312 aa17.44■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 HSFY1Q96LI6 401 aa17.44■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 USP34Q70CQ2 3546 aa17.44■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 EI24O14681 340 aa17.44■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 XIAPP98170 497 aa17.44■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 TAPT1Q6NXT6 567 aa17.44■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 POTEHQ6S545 545 aa17.44■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 GPR141Q7Z602 305 aa17.44■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 C3orf58Q8NDZ4 430 aa17.44■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 BCAP29Q9UHQ4 241 aa17.44■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 ADAM28Q9UKQ2 775 aa17.44■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 DGKBQ9Y6T7 804 aa17.44■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 A0A0J9YYE9 177 aa17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 GFAPP14136 432 aa17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 DAOAP59103 153 aa17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 IL1RL1Q01638 556 aa17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 PTPRRQ15256 657 aa17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 DTNBP1Q96EV8 351 aa17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 GPR78Q96P69 363 aa17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 ACOX2Q99424 681 aa17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 ADNPQ9H2P0 1102 aa17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 TMCO1Q9UM00 188 aa17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 IPPQ9Y573 584 aa17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 ATE1O95260 518 aa17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 RPS12P25398 132 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 TRAF2Q12933 501 aa17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 KLC3Q6P597 504 aa17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 C14orf80Q86SX3 495 aa17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 UNC93AQ86WB7 457 aa17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 ASB9Q96DX5 294 aa17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-201ENST00000155840 AKTIPQ9H8T0 292 aa17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms