RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 RBM10P98175 930 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
PMS1-222ENST00000639501 MCTP1Q6DN14 999 aa25.42■■□□□ 1.66
PMS1-222ENST00000639501 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PMS1-222ENST00000639501 MSNP26038 577 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PMS1-222ENST00000639501 PKP1Q13835 747 aa25.42■■□□□ 1.66
PMS1-222ENST00000639501 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
PMS1-222ENST00000639501 EVC2Q86UK5 1308 aa25.41■■□□□ 1.66
PMS1-222ENST00000639501 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.41■■□□□ 1.66
PMS1-222ENST00000639501 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.41■■□□□ 1.66
PMS1-222ENST00000639501 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.4■■□□□ 1.66
PMS1-222ENST00000639501 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
PMS1-222ENST00000639501 ZNF445P59923 1031 aa25.4■■□□□ 1.66
PMS1-222ENST00000639501 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
PMS1-222ENST00000639501 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
PMS1-222ENST00000639501 GCC1Q96CN9 775 aa25.4■■□□□ 1.66
PMS1-222ENST00000639501 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa25.39■■□□□ 1.66
PMS1-222ENST00000639501 AGLP35573 1532 aa25.39■■□□□ 1.66
PMS1-222ENST00000639501 RBSNQ9H1K0 784 aa25.39■■□□□ 1.65
PMS1-222ENST00000639501 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
PMS1-222ENST00000639501 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
PMS1-222ENST00000639501 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.38■■□□□ 1.65
PMS1-222ENST00000639501 NCLP19338 710 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PMS1-222ENST00000639501 MLECQ14165 292 aa25.38■■□□□ 1.65
PMS1-222ENST00000639501 NPATQ14207 1427 aa25.38■■□□□ 1.65
PMS1-222ENST00000639501 LMBRD1Q9NUN5 540 aa25.37■■□□□ 1.65
PMS1-222ENST00000639501 CDC45O75419 566 aa25.37■■□□□ 1.65
PMS1-222ENST00000639501 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
PMS1-222ENST00000639501 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
PMS1-222ENST00000639501 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
PMS1-222ENST00000639501 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.34■■□□□ 1.65
PMS1-222ENST00000639501 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
PMS1-222ENST00000639501 TSPYL6Q8N831 410 aa25.34■■□□□ 1.65
PMS1-222ENST00000639501 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
PMS1-222ENST00000639501 CHAMP1Q96JM3 812 aa25.33■■□□□ 1.65
PMS1-222ENST00000639501 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
PMS1-222ENST00000639501 PIK3R4Q99570 1358 aa25.33■■□□□ 1.65
PMS1-222ENST00000639501 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
PMS1-222ENST00000639501 PDLIM2Q96JY6 352 aa25.33■■□□□ 1.65
PMS1-222ENST00000639501 PTCH1Q13635 1447 aa25.33■■□□□ 1.65
PMS1-222ENST00000639501 FYB1O15117 783 aa25.32■■□□□ 1.64
PMS1-222ENST00000639501 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PMS1-222ENST00000639501 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
PMS1-222ENST00000639501 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PMS1-222ENST00000639501 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
PMS1-222ENST00000639501 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.31■■□□□ 1.64
PMS1-222ENST00000639501 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
PMS1-222ENST00000639501 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
PMS1-222ENST00000639501 GPT2Q8TD30 523 aa25.31■■□□□ 1.64
PMS1-222ENST00000639501 FAM13BQ9NYF5 915 aa25.31■■□□□ 1.64
PMS1-222ENST00000639501 RABEP1Q15276 862 aa25.3■■□□□ 1.64
PMS1-222ENST00000639501 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.3■■□□□ 1.64
PMS1-222ENST00000639501 VAMP4O75379 141 aa25.3■■□□□ 1.64
PMS1-222ENST00000639501 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.3■■□□□ 1.64
PMS1-222ENST00000639501 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
PMS1-222ENST00000639501 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa25.29■■□□□ 1.64
PMS1-222ENST00000639501 TERF1P54274 439 aa25.29■■□□□ 1.64
PMS1-222ENST00000639501 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
PMS1-222ENST00000639501 NUCB2P80303 420 aa25.28■■□□□ 1.64
PMS1-222ENST00000639501 HS1BP3Q53T59 392 aa25.28■■□□□ 1.64
PMS1-222ENST00000639501 ABCC4O15439 1325 aa25.28■■□□□ 1.64
PMS1-222ENST00000639501 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
PMS1-222ENST00000639501 PRKAR2BP31323 418 aa25.27■■□□□ 1.64
PMS1-222ENST00000639501 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
PMS1-222ENST00000639501 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
PMS1-222ENST00000639501 ZDHHC9Q9Y397 364 aa25.27■■□□□ 1.64
PMS1-222ENST00000639501 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PMS1-222ENST00000639501 USP26Q9BXU7 913 aa25.26■■□□□ 1.63
PMS1-222ENST00000639501 CD163L1Q9NR16 1453 aa25.26■■□□□ 1.63
PMS1-222ENST00000639501 FBLN1P23142 703 aa25.26■■□□□ 1.63
PMS1-222ENST00000639501 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PMS1-222ENST00000639501 UQCRHLA0A096LP55 91 aa25.25■■□□□ 1.63
PMS1-222ENST00000639501 UQCRHP07919 91 aa25.25■■□□□ 1.63
PMS1-222ENST00000639501 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25.25■■□□□ 1.63
PMS1-222ENST00000639501 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PMS1-222ENST00000639501 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.25■■□□□ 1.63
PMS1-222ENST00000639501 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.25■■□□□ 1.63
PMS1-222ENST00000639501 TTC22Q5TAA0 569 aa25.24■■□□□ 1.63
PMS1-222ENST00000639501 ARHGAP45Q92619 1136 aa25.24■■□□□ 1.63
PMS1-222ENST00000639501 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.24■■□□□ 1.63
PMS1-222ENST00000639501 TMEM63CQ9P1W3 806 aa25.24■■□□□ 1.63
PMS1-222ENST00000639501 STK26Q9P289 416 aa25.23■■□□□ 1.63
PMS1-222ENST00000639501 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa25.23■■□□□ 1.63
PMS1-222ENST00000639501 ZNF428Q96B54 188 aa25.22■■□□□ 1.63
PMS1-222ENST00000639501 ARID3AQ99856 593 aa25.21■■□□□ 1.63
PMS1-222ENST00000639501 SYCE3A1L190 88 aa25.21■■□□□ 1.63
PMS1-222ENST00000639501 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PMS1-222ENST00000639501 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.2■■□□□ 1.63
PMS1-222ENST00000639501 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.2■■□□□ 1.63
PMS1-222ENST00000639501 FCHSD2O94868 740 aa25.2■■□□□ 1.62
PMS1-222ENST00000639501 PRDM4Q9UKN5 801 aa25.2■■□□□ 1.62
PMS1-222ENST00000639501 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.2■■□□□ 1.62
PMS1-222ENST00000639501 HMOX1P09601 288 aa25.2■■□□□ 1.62
PMS1-222ENST00000639501 MBIPQ9NS73 344 aa25.2■■□□□ 1.62
PMS1-222ENST00000639501 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PMS1-222ENST00000639501 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PMS1-222ENST00000639501 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.19■■□□□ 1.62
PMS1-222ENST00000639501 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PMS1-222ENST00000639501 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PMS1-222ENST00000639501 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
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