RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616558.4

SYTL1-210, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYTL1, Length 1,878 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-210ENST00000616558 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
SYTL1-210ENST00000616558 E9PSI1 815 aa25.43■■□□□ 1.66
SYTL1-210ENST00000616558 LTN1O94822 1766 aa25.42■■□□□ 1.66
SYTL1-210ENST00000616558 ZBTB7CA1YPR0 619 aa25.42■■□□□ 1.66
SYTL1-210ENST00000616558 RIPK4P57078 832 aa25.41■■□□□ 1.66
SYTL1-210ENST00000616558 CCDC27Q2M243 656 aa25.41■■□□□ 1.66
SYTL1-210ENST00000616558 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.41■■□□□ 1.66
SYTL1-210ENST00000616558 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
SYTL1-210ENST00000616558 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.4■■□□□ 1.66
SYTL1-210ENST00000616558 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.4■■□□□ 1.66
SYTL1-210ENST00000616558 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
SYTL1-210ENST00000616558 HOXC9P31274 260 aa25.38■■□□□ 1.65
SYTL1-210ENST00000616558 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.38■■□□□ 1.65
SYTL1-210ENST00000616558 WDR63Q8IWG1 891 aa25.38■■□□□ 1.65
SYTL1-210ENST00000616558 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.37■■□□□ 1.65
SYTL1-210ENST00000616558 NFAT5O94916 1531 aa25.37■■□□□ 1.65
SYTL1-210ENST00000616558 KCNH5Q8NCM2 988 aa25.36■■□□□ 1.65
SYTL1-210ENST00000616558 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
SYTL1-210ENST00000616558 RGPD1P0DJD0 1748 aa25.36■■□□□ 1.65
SYTL1-210ENST00000616558 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.36■■□□□ 1.65
SYTL1-210ENST00000616558 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SYTL1-210ENST00000616558 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SYTL1-210ENST00000616558 ALS2Q96Q42 1657 aa25.34■■□□□ 1.65
SYTL1-210ENST00000616558 GCP02774 474 aa25.34■■□□□ 1.65
SYTL1-210ENST00000616558 NFE2L2Q16236 605 aa25.34■■□□□ 1.65
SYTL1-210ENST00000616558 BRINP3Q76B58 766 aa25.34■■□□□ 1.65
SYTL1-210ENST00000616558 SLAIN2Q9P270 581 aa25.33■■□□□ 1.65
SYTL1-210ENST00000616558 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.32■■□□□ 1.64
SYTL1-210ENST00000616558 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.31■■□□□ 1.64
SYTL1-210ENST00000616558 SLIT3O75094 1523 aa25.31■■□□□ 1.64
SYTL1-210ENST00000616558 EYA1Q99502 592 aa25.31■■□□□ 1.64
SYTL1-210ENST00000616558 ARHGEF10O15013 1369 aa25.3■■□□□ 1.64
SYTL1-210ENST00000616558 RTL1A6NKG5 1358 aa25.3■■□□□ 1.64
SYTL1-210ENST00000616558 USP19O94966 1318 aa25.29■■□□□ 1.64
SYTL1-210ENST00000616558 PLIN1O60240 522 aa25.29■■□□□ 1.64
SYTL1-210ENST00000616558 IP6K1Q92551 441 aa25.28■■□□□ 1.64
SYTL1-210ENST00000616558 MYH16Q9H6N6 1097 aa25.28■■□□□ 1.64
SYTL1-210ENST00000616558 PXDNQ92626 1479 aa25.28■■□□□ 1.64
SYTL1-210ENST00000616558 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
SYTL1-210ENST00000616558 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.26■■□□□ 1.63
SYTL1-210ENST00000616558 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SYTL1-210ENST00000616558 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
SYTL1-210ENST00000616558 TNS3Q68CZ2 1445 aa25.26■■□□□ 1.63
SYTL1-210ENST00000616558 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SYTL1-210ENST00000616558 ARHGEF25Q86VW2 580 aa25.25■■□□□ 1.63
SYTL1-210ENST00000616558 CABLES1Q8TDN4 633 aa25.25■■□□□ 1.63
SYTL1-210ENST00000616558 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.24■■□□□ 1.63
SYTL1-210ENST00000616558 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.23■■□□□ 1.63
SYTL1-210ENST00000616558 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SYTL1-210ENST00000616558 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.23■■□□□ 1.63
SYTL1-210ENST00000616558 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SYTL1-210ENST00000616558 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa25.22■■□□□ 1.63
SYTL1-210ENST00000616558 FAM83GA6ND36 823 aa25.22■■□□□ 1.63
SYTL1-210ENST00000616558 KDRP35968 1356 aa25.21■■□□□ 1.63
SYTL1-210ENST00000616558 RGPD2P0DJD1 1756 aa25.21■■□□□ 1.63
SYTL1-210ENST00000616558 IL16Q14005 1332 aa25.21■■□□□ 1.63
SYTL1-210ENST00000616558 BCAR3O75815 825 aa25.2■■□□□ 1.62
SYTL1-210ENST00000616558 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.2■■□□□ 1.62
SYTL1-210ENST00000616558 DCTN1Q14203 1278 aa25.2■■□□□ 1.62
SYTL1-210ENST00000616558 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.2■■□□□ 1.62
SYTL1-210ENST00000616558 RGPD5Q99666 1765 aa25.19■■□□□ 1.62
SYTL1-210ENST00000616558 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SYTL1-210ENST00000616558 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SYTL1-210ENST00000616558 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SYTL1-210ENST00000616558 NBPF6Q5VWK0 638 aa25.17■■□□□ 1.62
SYTL1-210ENST00000616558 NBPF4Q96M43 638 aa25.17■■□□□ 1.62
SYTL1-210ENST00000616558 AXIN2Q9Y2T1 843 aa25.17■■□□□ 1.62
SYTL1-210ENST00000616558 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SYTL1-210ENST00000616558 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.15■■□□□ 1.62
SYTL1-210ENST00000616558 ANKRD24Q8TF21 1146 aa25.15■■□□□ 1.62
SYTL1-210ENST00000616558 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.15■■□□□ 1.62
SYTL1-210ENST00000616558 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.15■■□□□ 1.62
SYTL1-210ENST00000616558 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SYTL1-210ENST00000616558 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SYTL1-210ENST00000616558 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa25.14■■□□□ 1.62
SYTL1-210ENST00000616558 MCM10Q7L590 875 aa25.14■■□□□ 1.61
SYTL1-210ENST00000616558 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.13■■□□□ 1.61
SYTL1-210ENST00000616558 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.12■■□□□ 1.61
SYTL1-210ENST00000616558 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SYTL1-210ENST00000616558 NHSL1Q5SYE7 1610 aa25.11■■□□□ 1.61
SYTL1-210ENST00000616558 CHRNA2Q15822 529 aa25.11■■□□□ 1.61
SYTL1-210ENST00000616558 GNAI1P63096 354 aa25.11■■□□□ 1.61
SYTL1-210ENST00000616558 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.11■■□□□ 1.61
SYTL1-210ENST00000616558 CRBNQ96SW2 442 aa25.11■■□□□ 1.61
SYTL1-210ENST00000616558 IFT57Q9NWB7 429 aa25.11■■□□□ 1.61
SYTL1-210ENST00000616558 CANXP27824 592 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SYTL1-210ENST00000616558 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SYTL1-210ENST00000616558 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SYTL1-210ENST00000616558 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SYTL1-210ENST00000616558 KIAA0232Q92628 1395 aa25.08■■□□□ 1.61
SYTL1-210ENST00000616558 MBIPQ9NS73 344 aa25.08■■□□□ 1.61
SYTL1-210ENST00000616558 CFAP44Q96MT7 982 aa25.07■■□□□ 1.6
SYTL1-210ENST00000616558 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.06■■□□□ 1.6
SYTL1-210ENST00000616558 ERBB3P21860 1342 aa25.06■■□□□ 1.6
SYTL1-210ENST00000616558 ZNF853P0CG23 659 aa25.06■■□□□ 1.6
SYTL1-210ENST00000616558 COL18A1P39060 1754 aa25.06■■□□□ 1.6
SYTL1-210ENST00000616558 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.05■■□□□ 1.6
SYTL1-210ENST00000616558 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SYTL1-210ENST00000616558 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.03■■□□□ 1.6
SYTL1-210ENST00000616558 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms