RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607561.1

RNU6-87P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 87, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-87P, Length 108 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-87P-201ENST00000607561 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 ALDH1A1P00352 501 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 ESPNB1AK53 854 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 SMPD1P17405 629 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 PHTF2Q8N3S3 785 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 GLMNQ92990 594 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 GFRA3O60609 400 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 ADH1CP00326 375 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 C1orf115Q9H7X2 142 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 TSGA10IPQ3SY00 556 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZNF592Q92610 1267 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 PIK3CDO00329 1044 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 NR3C2P08235 984 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 FSHRP23945 695 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 NR5A1Q13285 461 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 NBPF20Q3BBV1 942 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 WASF2Q9Y6W5 498 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 RAB15P59190 212 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 HPS1Q92902 700 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 UCN2Q96RP3 112 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 CHIC2Q9UKJ5 165 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-87P-201ENST00000607561 ERVH48-1M5A8F1 160 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 NNTQ13423 1086 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 SLFNL1Q499Z3 407 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 SEPT12Q8IYM1 358 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 RNF20Q5VTR2 975 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 RNF135Q8IUD6 432 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 CCDC116Q8IYX3 515 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 FAM187AA6NFU0 413 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 DGAT1O75907 488 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 SKIP12755 728 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 LAPTM4AQ15012 233 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 TRAF7Q6Q0C0 670 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 CCDC125Q86Z20 511 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 ATP9BO43861 1147 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 AVPP01185 164 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 TIMP2P16035 220 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 WDR4P57081 412 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 ITPKCQ96DU7 683 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 LILRA1O75019 489 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 ADD1P35611 737 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 MAP7D1Q3KQU3 841 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 CCDC82Q8N4S0 544 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 DOLKQ9UPQ8 538 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 SCTRP47872 440 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 PKDCCQ504Y2 493 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 CFAP70Q5T0N1 1121 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 DEPDC4Q8N2C3 294 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 SERPINA10Q9UK55 444 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 ERVK-9P63128 1117 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 MYT1Q01538 1121 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 CBLBQ13191 982 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 CYLDQ9NQC7 956 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 USP17L5A8MUK1 530 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 NCOA4Q13772 614 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 USP17L3A6NCW0 530 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 USP17L4A6NCW7 530 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 RFX1P22670 979 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 USP4Q13107 963 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 USP17L2Q6R6M4 530 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 Q6ZVU0 165 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 USP17L1Q7RTZ2 530 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 OSBPL3Q9H4L5 887 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
RNU6-87P-201ENST00000607561 CRIPAKQ8N1N5 446 aa7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms