RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597589.5

PRKD2-209, Transcript of protein kinase D2, human

TSL 5

Gene PRKD2, Length 1,682 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKD2-209	ENST00000597589	HMOX1	P09601	288 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PRKD2-209	ENST00000597589	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PRKD2-209	ENST00000597589	NFAT5	O94916	1531 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PRKD2-209	ENST00000597589	LTN1	O94822	1766 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PRKD2-209	ENST00000597589	SOX12	O15370	315 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PRKD2-209	ENST00000597589	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PRKD2-209	ENST00000597589	MSH6	P52701	1360 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PRKD2-209	ENST00000597589	IL16	Q14005	1332 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PRKD2-209	ENST00000597589	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
PRKD2-209	ENST00000597589	RIPK4	P57078	832 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PRKD2-209	ENST00000597589	RTL1	A6NKG5	1358 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PRKD2-209	ENST00000597589	FOXO3	O43524	673 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PRKD2-209	ENST00000597589	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PRKD2-209	ENST00000597589	ARHGEF10	O15013	1369 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PRKD2-209	ENST00000597589	AMPH	P49418	695 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PRKD2-209	ENST00000597589	NFE2L2	Q16236	605 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PRKD2-209	ENST00000597589	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PRKD2-209	ENST00000597589	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PRKD2-209	ENST00000597589	SLIT3	O75094	1523 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PRKD2-209	ENST00000597589	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	32.13	■■■□□ 2.73
PRKD2-209	ENST00000597589	ALS2	Q96Q42	1657 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PRKD2-209	ENST00000597589	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PRKD2-209	ENST00000597589	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PRKD2-209	ENST00000597589	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PRKD2-209	ENST00000597589	HOXC9	P31274	260 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PRKD2-209	ENST00000597589	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PRKD2-209	ENST00000597589	KDR	P35968	1356 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PRKD2-209	ENST00000597589	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
PRKD2-209	ENST00000597589	USP19	O94966	1318 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PRKD2-209	ENST00000597589	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PRKD2-209	ENST00000597589	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PRKD2-209	ENST00000597589	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
PRKD2-209	ENST00000597589	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PRKD2-209	ENST00000597589	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
PRKD2-209	ENST00000597589	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
PRKD2-209	ENST00000597589	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PRKD2-209	ENST00000597589	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	32.02	■■■□□ 2.72
PRKD2-209	ENST00000597589	PLIN1	O60240	522 aa		32.01	■■■□□ 2.71
PRKD2-209	ENST00000597589	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		32	■■■□□ 2.71
PRKD2-209	ENST00000597589	IP6K1	Q92551	441 aa		32	■■■□□ 2.71
PRKD2-209	ENST00000597589	EYA1	Q99502	592 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PRKD2-209	ENST00000597589	PXDN	Q92626	1479 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PRKD2-209	ENST00000597589	GC	P02774	474 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PRKD2-209	ENST00000597589	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		31.95	■■■□□ 2.7
PRKD2-209	ENST00000597589	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PRKD2-209	ENST00000597589	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	31.94	■■■□□ 2.7
PRKD2-209	ENST00000597589	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	31.94	■■■□□ 2.7
PRKD2-209	ENST00000597589	BCAR3	O75815	825 aa		31.93	■■■□□ 2.7
PRKD2-209	ENST00000597589	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	31.93	■■■□□ 2.7
PRKD2-209	ENST00000597589	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		31.93	■■■□□ 2.7
PRKD2-209	ENST00000597589	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PRKD2-209	ENST00000597589	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PRKD2-209	ENST00000597589	IFT57	Q9NWB7	429 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PRKD2-209	ENST00000597589	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		31.9	■■■□□ 2.7
PRKD2-209	ENST00000597589	GNAI1	P63096	354 aa		31.89	■■■□□ 2.7
PRKD2-209	ENST00000597589	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		31.89	■■■□□ 2.7
PRKD2-209	ENST00000597589	ZNF853	P0CG23	659 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PRKD2-209	ENST00000597589	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	31.88	■■■□□ 2.69
PRKD2-209	ENST00000597589	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PRKD2-209	ENST00000597589	BRINP3	Q76B58	766 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PRKD2-209	ENST00000597589	CRBN	Q96SW2	442 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PRKD2-209	ENST00000597589	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	31.86	■■■□□ 2.69
PRKD2-209	ENST00000597589	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PRKD2-209	ENST00000597589	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	31.85	■■■□□ 2.69
PRKD2-209	ENST00000597589	SLAIN2	Q9P270	581 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PRKD2-209	ENST00000597589	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PRKD2-209	ENST00000597589	PDE3A	Q14432	1141 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PRKD2-209	ENST00000597589	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PRKD2-209	ENST00000597589	CFAP44	Q96MT7	982 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PRKD2-209	ENST00000597589	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PRKD2-209	ENST00000597589	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	31.83	■■■□□ 2.69
PRKD2-209	ENST00000597589	ABCC6	O95255	1503 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PRKD2-209	ENST00000597589	NCAPD2	Q15021	1401 aa		31.82	■■■□□ 2.68
PRKD2-209	ENST00000597589	FAM83G	A6ND36	823 aa		31.82	■■■□□ 2.68
PRKD2-209	ENST00000597589	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
PRKD2-209	ENST00000597589	ZNF428	Q96B54	188 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PRKD2-209	ENST00000597589	RGPD5	Q99666	1765 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PRKD2-209	ENST00000597589	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	31.79	■■■□□ 2.68
PRKD2-209	ENST00000597589	LRRC37A3	O60309	1634 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PRKD2-209	ENST00000597589	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PRKD2-209	ENST00000597589	MBIP	Q9NS73	344 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PRKD2-209	ENST00000597589	COL18A1	P39060	1754 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PRKD2-209	ENST00000597589	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		31.77	■■■□□ 2.68
PRKD2-209	ENST00000597589	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
PRKD2-209	ENST00000597589	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
PRKD2-209	ENST00000597589	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	31.77	■■■□□ 2.68
PRKD2-209	ENST00000597589	DCTN1	Q14203	1278 aa		31.76	■■■□□ 2.68
PRKD2-209	ENST00000597589	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		31.76	■■■□□ 2.67
PRKD2-209	ENST00000597589	NBPF4	Q96M43	638 aa		31.76	■■■□□ 2.67
PRKD2-209	ENST00000597589	CRB1	P82279	1406 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PRKD2-209	ENST00000597589	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PRKD2-209	ENST00000597589	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PRKD2-209	ENST00000597589	MCM10	Q7L590	875 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PRKD2-209	ENST00000597589	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PRKD2-209	ENST00000597589	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	31.73	■■■□□ 2.67
PRKD2-209	ENST00000597589	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
PRKD2-209	ENST00000597589	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	31.72	■■■□□ 2.67
PRKD2-209	ENST00000597589	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		31.72	■■■□□ 2.67
PRKD2-209	ENST00000597589	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		31.72	■■■□□ 2.67
PRKD2-209	ENST00000597589	PLEKHG5	O94827	1062 aa		31.71	■■■□□ 2.67

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