RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 SLC16A10Q8TF71 515 aa9.21□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 ZFP42Q96MM3 310 aa9.21□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 BARGINQ6ZT62 677 aa9.2□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 NNTQ13423 1086 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 AMHR2Q16671 573 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 TNIKQ9UKE5 1360 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 PTPRGP23470 1445 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 ABCC2Q92887 1545 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 LORP23490 312 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 ERBB4Q15303 1308 aa9.18□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 BEGAINQ9BUH8 593 aa9.18□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 H3BM21 787 aa9.17□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 VARSP26640 1264 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 DESI1Q6ICB0 168 aa9.17□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa9.17□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 CFAP99D6REC4 459 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 TIMP2P16035 220 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 CTHP32929 405 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 IRF7Q92985 503 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 TBC1D2Q9BYX2 928 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 TSPOAP1O95153 1857 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 KDM5BQ9UGL1 1544 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 SPDYE5A6NIY4 337 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 SOBPA7XYQ1 873 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 FOXJ1Q92949 421 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 SLC24A3Q9HC58 644 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 MAP10Q9P2G4 905 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-212ENST00000597259 GLI2P10070 1586 aa9.15□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 UACAQ9BZF9 1416 aa9.14□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 PLEKHG3A1L390 1219 aa9.14□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 WDR4P57081 412 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 FAM69CQ0P6D2 419 aa9.14□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 LYPD8Q6UX82 237 aa9.14□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 NPAS3Q8IXF0 933 aa9.14□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 MPNDQ8N594 471 aa9.14□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 ABCA8O94911 1581 aa9.14□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 ADH1CP00326 375 aa9.13□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 TPRNQ4KMQ1 711 aa9.13□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 PARP9Q8IXQ6 854 aa9.13□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 PLB1Q6P1J6 1458 aa9.13□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 ASXL2Q76L83 1435 aa9.13□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa9.13□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 SAMD9Q5K651 1589 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 F12P00748 615 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 HRCP23327 699 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 FAM174AQ8TBP5 190 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 CABLES1Q8TDN4 633 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 ZFAND3Q9H8U3 227 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 KDM6BO15054 1643 aa9.1□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 GJA5P36382 358 aa9.1□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 SCARF1Q14162 830 aa9.1□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 ARID5BQ14865 1188 aa9.1□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.1□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 SPTLC1O15269 473 aa9.09□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 NR3C2P08235 984 aa9.09□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa9.09□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 CDK15Q96Q40 435 aa9.09□□□□□ -0.95
HERC3-212ENST00000597259 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
HERC3-212ENST00000597259 ITPKCQ96DU7 683 aa9.08□□□□□ -0.96
HERC3-212ENST00000597259 ZBTB3Q9H5J0 574 aa9.08□□□□□ -0.96
HERC3-212ENST00000597259 FAM181BA6NEQ2 426 aa9.07□□□□□ -0.96
HERC3-212ENST00000597259 TRIM66O15016 1216 aa9.07□□□□□ -0.96
HERC3-212ENST00000597259 RIC3Q7Z5B4 369 aa9.07□□□□□ -0.96
HERC3-212ENST00000597259 GOLGA3Q08378 1498 aa9.07□□□□□ -0.96
HERC3-212ENST00000597259 DIXDC1Q155Q3 683 aa9.06□□□□□ -0.96
HERC3-212ENST00000597259 C6orf118Q5T5N4 469 aa9.06□□□□□ -0.96
HERC3-212ENST00000597259 AK7Q96M32 723 aa9.06□□□□□ -0.96
HERC3-212ENST00000597259 WDR7Q9Y4E6 1490 aa9.05□□□□□ -0.96
HERC3-212ENST00000597259 GRM5P41594 1212 aa9.05□□□□□ -0.96
HERC3-212ENST00000597259 AGERQ15109 404 aa9.05□□□□□ -0.96
HERC3-212ENST00000597259 KIF21BO75037 1637 aa9.05□□□□□ -0.96
HERC3-212ENST00000597259 QPCTQ16769 361 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-212ENST00000597259 TSC1Q92574 1164 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-212ENST00000597259 LIMD1Q9UGP4 676 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-212ENST00000597259 EEA1Q15075 1411 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-212ENST00000597259 CFAP43Q8NDM7 1665 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-212ENST00000597259 ATP10BO94823 1461 aa9.03□□□□□ -0.96
HERC3-212ENST00000597259 VSIG8P0DPA2 414 aa9.03□□□□□ -0.96
HERC3-212ENST00000597259 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
HERC3-212ENST00000597259 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa9.02□□□□□ -0.96
HERC3-212ENST00000597259 MAN1A2O60476 641 aa9.02□□□□□ -0.97
HERC3-212ENST00000597259 NR5A1Q13285 461 aa9.02□□□□□ -0.97
HERC3-212ENST00000597259 MYSM1Q5VVJ2 828 aa9.01□□□□□ -0.97
HERC3-212ENST00000597259 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
HERC3-212ENST00000597259 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms