RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa29.93■■■□□ 2.38
CAPNS1-207ENST00000589146 DUSP27Q5VZP5 1158 aa29.93■■■□□ 2.38
CAPNS1-207ENST00000589146 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.93■■■□□ 2.38
CAPNS1-207ENST00000589146 E9PSI1 815 aa29.92■■■□□ 2.38
CAPNS1-207ENST00000589146 TMPOP42166 694 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
CAPNS1-207ENST00000589146 SOX12O15370 315 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-207ENST00000589146 PRKAR2BP31323 418 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-207ENST00000589146 AMPHP49418 695 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-207ENST00000589146 PXDNQ92626 1479 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-207ENST00000589146 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
CAPNS1-207ENST00000589146 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGEF10O15013 1369 aa29.89■■■□□ 2.37
CAPNS1-207ENST00000589146 HOXC9P31274 260 aa29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-207ENST00000589146 FKBP8Q14318 412 aa29.87■■■□□ 2.37
CAPNS1-207ENST00000589146 LTN1O94822 1766 aa29.87■■■□□ 2.37
CAPNS1-207ENST00000589146 NEFMP07197 916 aa29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-207ENST00000589146 BRINP3Q76B58 766 aa29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-207ENST00000589146 SLAIN2Q9P270 581 aa29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-207ENST00000589146 RCAN3Q9UKA8 241 aa29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-207ENST00000589146 HMOX1P09601 288 aa29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-207ENST00000589146 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-207ENST00000589146 NEUROD2Q15784 382 aa29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-207ENST00000589146 ERICH6BQ5W0A0 696 aa29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-207ENST00000589146 IP6K1Q92551 441 aa29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM35Q9UPQ4 493 aa29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-207ENST00000589146 TNS3Q68CZ2 1445 aa29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-207ENST00000589146 GCP02774 474 aa29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-207ENST00000589146 NFE2L2Q16236 605 aa29.82■■■□□ 2.36
CAPNS1-207ENST00000589146 KDRP35968 1356 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-207ENST00000589146 IL16Q14005 1332 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-207ENST00000589146 IGSF1Q8N6C5 1336 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-207ENST00000589146 PHACTR3Q96KR7 559 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-207ENST00000589146 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-207ENST00000589146 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-207ENST00000589146 RIPK4P57078 832 aa29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGEF25Q86VW2 580 aa29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-207ENST00000589146 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-207ENST00000589146 SULT6B1Q6IMI4 303 aa29.79■■■□□ 2.36
CAPNS1-207ENST00000589146 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
CAPNS1-207ENST00000589146 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-207ENST00000589146 AEBP1Q8IUX7 1158 aa29.76■■■□□ 2.35
CAPNS1-207ENST00000589146 EYA1Q99502 592 aa29.76■■■□□ 2.35
CAPNS1-207ENST00000589146 LMOD2Q6P5Q4 547 aa29.75■■■□□ 2.35
CAPNS1-207ENST00000589146 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa29.75■■■□□ 2.35
CAPNS1-207ENST00000589146 NHSL1Q5SYE7 1610 aa29.74■■■□□ 2.35
CAPNS1-207ENST00000589146 MYH16Q9H6N6 1097 aa29.73■■■□□ 2.35
CAPNS1-207ENST00000589146 RRP1P56182 461 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
CAPNS1-207ENST00000589146 LMOD3Q0VAK6 560 aa29.72■■■□□ 2.35
CAPNS1-207ENST00000589146 ABCC6O95255 1503 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-207ENST00000589146 DLG5Q8TDM6 1919 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-207ENST00000589146 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-207ENST00000589146 NCAPD2Q15021 1401 aa29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-207ENST00000589146 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
CAPNS1-207ENST00000589146 COL18A1P39060 1754 aa29.64■■■□□ 2.34
CAPNS1-207ENST00000589146 CPDO75976 1380 aa29.64■■■□□ 2.33
CAPNS1-207ENST00000589146 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-207ENST00000589146 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-207ENST00000589146 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-207ENST00000589146 FANCIQ9NVI1 1328 aa29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF853P0CG23 659 aa29.59■■■□□ 2.33
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CAPNS1-207ENST00000589146 GAS2L2Q8NHY3 880 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-207ENST00000589146 NBPF4Q96M43 638 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-207ENST00000589146 IFT57Q9NWB7 429 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKRD24Q8TF21 1146 aa29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-207ENST00000589146 LMO7Q8WWI1 1683 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-207ENST00000589146 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-207ENST00000589146 ZBTB7CA1YPR0 619 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-207ENST00000589146 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-207ENST00000589146 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-207ENST00000589146 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-207ENST00000589146 AXIN2Q9Y2T1 843 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-207ENST00000589146 GNAI1P63096 354 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP4R2Q9NY27 417 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-207ENST00000589146 RGPD2P0DJD1 1756 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-207ENST00000589146 CABLES1Q8TDN4 633 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-207ENST00000589146 RGPD5Q99666 1765 aa29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-207ENST00000589146 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-207ENST00000589146 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-207ENST00000589146 ABCA3Q99758 1704 aa29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-207ENST00000589146 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-207ENST00000589146 ERBB3P21860 1342 aa29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-207ENST00000589146 PLEKHG5O94827 1062 aa29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-207ENST00000589146 CFAP44Q96MT7 982 aa29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
CAPNS1-207ENST00000589146 RARSP54136 660 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
CAPNS1-207ENST00000589146 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM83GA6ND36 823 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-207ENST00000589146 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-207ENST00000589146 KIAA0232Q92628 1395 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-207ENST00000589146 USHBP1Q8N6Y0 703 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-207ENST00000589146 CRB1P82279 1406 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-207ENST00000589146 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRC37A3O60309 1634 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-207ENST00000589146 PLIN1O60240 522 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-207ENST00000589146 BCAR3O75815 825 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-207ENST00000589146 DCTN1Q14203 1278 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF428Q96B54 188 aa29.45■■■□□ 2.31
CAPNS1-207ENST00000589146 MAP3K5Q99683 1374 aa29.44■■■□□ 2.3
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